Présentation de la structure :
Situé à Grenoble, le laboratoire de recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité (TIMC) réunit scientifiques, cliniciens, personnels techniques et administratifs autour de l'utilisation de l'informatique et des mathématiques appliquées pour la compréhension et le contrôle des processus normaux et pathologiques en biologie et santé.
Sous l'autorité de Fabien Pierrel, l'équipe TrEE est composée de 15 permanents (12 enseignants-chercheurs, 2 chercheurs), 8 doctorants, 4 BIATSS et 2 personnels administratifs.
Les membres de l'équipe TrEE combinent des approches interdisciplinaires expérimentales et in silico pour comprendre les mécanismes évolutifs d'adaptation des microorganismes à leur environnement ou à l'hôte qu'ils habitent ou infectent, et pour développer des applications biotechnologiques. Nous étudions la dynamique des interactions au sein de la cellule, au sein de populations microbiennes, et entre ces populations microbiennes et leur environnement / hôte. Cinq axes de recherches forment un continuum entre recherche fondamentale et translationnelle dans un objectif de progrès de la connaissance et d'innovation diagnostique et / ou thérapeutique.
https://www.timc.fr/TrEE
Missions principales :
Participer au projet PhytoFONG en réalisant des tests de détection des résistances des phytopathogènes aux fongicides. Tests manuels et tests réalisés avec l'automate de pipetage du laboratoire que le / la technicien(ne) devra utiliser pour compléter les tests effectués par la doctorante recrutée sur le projet PhytoFong. Le test PhytoFong consiste en :
1-mise en plaque :
- d'une suspension calibrée de spores fongiques
- de différentes concentrations de fongicides -d'un marqueur fluorescent
2- analyse par microscopie à fluorescence avec prise automatisée des images
3- sortie des résultats avec un logiciel d'analyse
Missions secondaires : participer au développement du test sur cytomètre en flux et à la caractérisation d'autres marqueurs pouvant être utilisés dans le test PhytoFong. Participer à l'analyse des prélèvements de sols et végétaux pour la détection des champignons phytopathogènes et de leurs résistances.
Activités principales :
- Conduire les expériences de biologie en effectuant manuellement et automatiquement le test phytoFong sur les principales espèces phytopathogènes avec les principaux fongicides et sur le champignon pathogène opportuniste humain Aspergillus fumigatus. Rassembler et mettre en forme les résultats et les analyser avec la doctorante et ses encadrantes.
- Mettre en culture les prélèvements de terrain (sols et végétaux) et détecter les résistances des souches de phytopathogènes d'intérêt.
- Préparer les milieux de cultures.
- Mise en culture des prélévements- identification des colonies.
- Conservation des souches isolées. Participation au développement du test sur cytomètre en flux en testant de nouveaux marqueurs avec la doctorante et l'enseignante-chercheuse en charge de ce projet.
- Rédiger et actualiser les protocoles techniques, tenir un cahier de laboratoire.
- Préparer l'appareillage et effectuer les contrôles et réglages systématiques.
- Surveiller les appareillages et en assurer la maintenance de premier niveau.
- Gérer les stocks et les commandes.
- Participer à la formation technique des utilisateurs et des stagiaires.
BTS de technicien de laboratoire.
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