Mission :
L'Ingénieur recruté· jouera un rôle central dans la stabilisation de l'outil, structuration de l'évaluation, packaging, documentation, mise en conformité FAIR, et contribution directe à la rédaction scientifique (manuscrit, figures, supplément). En parallèle, il/elle posera les fondations méthodologiques et logicielles de l'alignement cross-modality entre cartes transcriptomiques et métabolomiques (géométrie, résolution, voisinages, correspondances probabilistes)..
Activités :
- Finalisation de SpacePath : consolidation du code (refactoring, tests, packaging), optimisation/robustesse, API/CLI, documentation et tutoriels, workflows reproductibles (conda/containers, notebooks).
- Évaluation et validation : protocole de benchmarking (baselines, ablations, métriques), analyses de robustesse, production des figures et suppléments “publication-grade”.
Publication et dissémination : contribution majeure au manuscrit (Méthodes/Résultats), préparation des dépôts (code, documentation, éventuellement jeux de données démo) et matériel de diffusion.
- Démarrage de l'alignement spatial transcriptomique–métabolomique : définition de la stratégie (géométrie multi-échelle, correspondances probabilistes/graphes/OT), prototypage et preuve de concept sur un ou deux couples de jeux de données.
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