PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin off de l’Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d’origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de la réception des échantillons à la production des certificats d’analyse. Ses tests utilisent des protocoles propriétaires de traitement des échantillons, une plateforme de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) et des pipelines d’analyses bio-informatiques spécialisés. Nous recherchons actuellement un Ingénieur Bio-informatique h/f au sein de notre département Opérations.
Au sein du département Opérations, sous la responsabilité du Responsable Pole BFX opérations et avec le support scientifique et technique du Head of Bioinformatics, vous assurez le suivi, l'exécution et le rendu dans les délais des analyses bio-informatiques des données produites par les plates-formes de séquençage de la société, principalement celles qui concernent les prestations de sécurité virale et de caractérisation génétique ainsi que les études client à façon (« custom »).
· Participer aux activités de production de l’entreprise et à leurs évolutions
· Participer au nettoyage des données présentes sur les serveurs
· Participer à la formation du personnel sur les pipelines maîtrisés et au maintien des supports de formation.
· Suivre la démarche qualité de l’entreprise lors des phases de conception, de développement et de déploiement des produits logiciels (bio)informatiques, notamment en rédigeant les documents associés (spécifications fonctionnelles, cahier de tests)
· Participer à la rédaction de procédures et modes opératoires relatifs à l’activité Bio-informatique
· Assurer une veille technologique efficace en (bio)informatique
· De formation en bio-informatique, vous avez une expérience sur une fonction similaire sur Illumina ou Nanopore.
Vous maîtrisez les langages de développement bio-informatique tels que Python et R.
Vous êtes à l’aise de travailler dans un environnement Linux et sur des serveurs de calcul haute performance.
Vous savez analyser des données de séquençage haut-débit et en interpréter les résultats.
Compétences techniques : Assemblage De Novo & Guidé, Mapping, Linux, NCBI, NGS, Blast, Variant calling.
Un bon niveau d’anglais est un plus.
· Ce poste est basé près du bureau de Paris (13e arrondissement) en France.
Les avantages du projet
Une entreprise à la pointe de la génétique, de la bio-informatique et de la biologie moléculaire
Nous remercions les personnes intéressées par ce poste et qui répondent aux critères ci-dessus de nous faire parvenir leur curriculum vitae à l’adresse careers@pathoquest.
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