Assistant-e en écologie microbienne appliquée aux bioprocédés environnementaux

Informations générales Organisme de rattachement Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE) Référence INRAE-CAMOB25-AI-MICA-1 Date de début de diffusion 17/11/2025 Date de parution 17/11/2025 Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Technicienne / Technicien en biologie - SVT Statut du poste Vacant Intitulé du poste Assistant-e en écologie microbienne appliquée aux bioprocédés environnementaux Descriptif de l'employeur L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes. Description du poste Vous exercerez votre activité au sein de l’unité de recherche (UR) PROSE (Procédés biotechnologiques au Service de l'Environnement) située à Antony (92) et qui comporte 22 agents permanents. L'activité de l'unité PROSE porte sur la compréhension et l'optimisation des procédés de biotechnologie environnementale (stations de traitement et de valorisation des eaux usées et méthanisation de déchets). Elle porte également sur la conception et l'évaluation de procédés innovants tels que les procédés bioélectrochimiques. L’UR PROSE développe depuis des méthodes originales couplant chimie analytique et biologie moléculaire et plus récemment des approches métaomiques, afin d’approfondir notre connaissance du fonctionnement des écosystèmes microbiens complexes impliqués dans les biotechnologies environnementales. Vous serez inséré-e dans cette dynamique en ayant pour mission d’optimiser et de réaliser des analyses d’écologie microbienne appliquée aux procédés de biotechnologie environnementale.Vous travaillerez en étroite collaboration avec les porteurs de projets de l’unité, le responsable du pôle analytique (7 agents), qui regroupe les activités analytiques chimiques et microbiologiques, ainsi que la responsable technique du laboratoire de microbiologie de l’unité, dans lequel vous serez intégré-e.L’activité du laboratoire repose sur l’utilisation de techniques variées de microbiologie et de biologie moléculaire, allant de la culture cellulaire et l’observation microscopique (technique FISH) à la préparation d’échantillons pour l’extraction d’acides nucléiques (ADN et ARN) ou de protéines, en vue de leur analyse via des approches telles que la PCR et le fingerprinting, la qPCR, le metabarcoding, la métagénomique, la métatranscriptomique et la métaprotéomique.Le laboratoire est notamment équipé d’une hotte à flux laminaire, d’étuves de culture, d’un microscope confocal et d’un microscope à épifluorescence, de thermocycleurs, d’un séquenceur de paillasse (MiSeq, Illumina), de séquenceurs portatifs (MinIon, Oxford Nanopore) et d’une ultracentrifugeuse.Vous serez en charge de :1) Conduire, en adaptant les conditions expérimentales et les protocoles, un ensemble de techniques de biologie moléculaire et microbiologie (parmi PCR, qPCR, RT-qPCR, microscopie FISH, séquençage, cytométrie en flux, culture aérobie et anaérobie…) :- choisir le protocole d'analyse et l'adapter en concertation avec les demandeurs ;- préparer les échantillons en vue de l'analyse à effectuer ;- extraire les résultats bruts, les mettre en forme et les présenter, en garantir la qualité ;- rédiger le cahier de laboratoire, les procédures expérimentales, les notes techniques, les rapports d'analyse.2) Participer à la gestion des moyens techniques du laboratoire :- détecter les dysfonctionnements et réaliser les opérations d'entretien, de maintenance et les dépannages de premier niveau ; Descriptif du profil recherché Formation recommandée en microbiologie, biologie moléculaire, biotechnologies.Une première expérience en analyse de matrices environnementales serait un plus.Connaissances et compétences opérationnelles :- Biologie et étude des microorganismes (connaissance générale) ;- Appareillages spécifiques : culture des microorganismes, pipettes, centrifugeuse, thermocycleur ;- Techniques de préparation d'échantillons (extraction acides nucléiques…) ;- Techniques d'analyse de biologie moléculaire (PCR) ;- Concepts de qualité appliqués aux techniques d'analyse chimique (notions de base) ;- Outils informatiques nécessaires à l'exploitation des résultats ;- Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité ;- Langue anglaise niveau B1.Qualités et savoirs être :- Sens de l'initiative ;- Sens critique ;-Sens de l'organisation ;-Sens relationnel ;-Rigueur / fiabilité. Localisation du poste Europe, France, Île-de-France Géolocalisation du poste 92160 ANTONY Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 92160 ANTONY Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 5 Diplômes de niveau bac 2 Date de vacance de l'emploi 01/02/2026