Déchiffrer la logique des arn viraux in vivo: une approche à l'échelle de la molécule unique de l'infection par les arbovirus // deciphering viral rna logic in vivo: a single-molecule view of arbovirus infection

Topic description

Les arbovirus tels que les virus Zika, Chikungunya et Sindbis, transmis à l'homme par les moustiques, constituent une menace persistante pour la santé mondiale. Pourtant, des aspects clés de leur cycle de réplication, en particulier la régulation de la traduction et de la réplication des ARN viraux, restent mal compris. Ce projet de doctorat vise à élucider ces mécanismes grâce à l'imagerie en temps réel de la traduction et de la réplication à l'échelle de la molécule unique, à la fois dans des cellules de mammifères et dans des embryons de poisson zèbre vivants, un modèle vertébré particulièrement adapté à la visualisation en temps réel des dynamiques virales. En combinant ingénierie génétique avancée, imagerie des ARN et microscopie de pointe, le/la doctorant(e) étudiera comment les régions non traduites (UTRs) 5′ et 3′ des virus contrôlent l'initiation de la traduction, la réplication et les interactions hôte–pathogène. Le projet inclura également le développement d'outils innovants pour cartographier la propagation de l'infection, quantifier les cinétiques de traduction et révéler la régulation spatio-temporelle des ARN viraux. À l'interface de la biologie moléculaire, de la biophysique et de l'analyse quantitative d'images, ce projet apportera de nouvelles connaissances sur les dynamiques de réplication des arbovirus et permettra d'identifier de potentielles cibles antivirales. À terme, il contribuera à une meilleure compréhension de la réplication virale et au développement de nouvelles stratégies antivirales.
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Arboviruses such as Zika, Chikungunya, and Sindbis viruses, transmitted by mosquitoes to humans, pose persistent global health threats, yet key aspects of their replication cycles, particularly the regulation of viral RNA translation and replication, remain poorly understood. This PhD project aims to elucidate these mechanisms using live imaging of translation and replication at single-molecule resolution in both mammalian cells and living zebrafish embryos, a vertebrate model uniquely suited for real-time visualization of viral dynamics. Combining advanced genetic engineering, live RNA imaging, and cutting-edge microscopy, the PhD candidate will investigate how viral 5′ and 3′ untranslated regions (UTRs) control translation initiation, replication, and host–pathogen interactions. The project will also develop innovative tools to map infection spread, quantify translation kinetics, and uncover the spatiotemporal regulation of viral RNA. By integrating molecular biology, biophysics, and quantitative image analysis, this research will provide new insights into arboviral replication dynamics and identify potential antiviral targets. Overall, the project aims to advance our understanding of viral replication and contribute to the development of novel antiviral strategies.
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Début de la thèse : 01/10/

Funding category

Public funding alone (i.e. government, region, European, international organization research grant)

Funding further details

Concours pour un contrat doctoral