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Offre de stage: mise en relation entre marqueurs épigénétiques de vigne ayant subi un stress environnemental et sensibilité au black rot.

Villenave-d'Ornon
Stage
4,5 € de l'heure
Publiée le Il y a 16 h
Description de l'offre

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.


Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’UMR 1065 Santé et Agroécologie du Vignoble de l’INRAE Nouvelle Aquitaine, Villlenave d’Ornon, dans l’équipe «Biorésilience» constituée de 3 chercheurs, et un assistant ingénieur et travaillerez en étroite collaboration avec une doctorante et un professeur de l’UMR EGFV. Vous serez recruté dans le cadre du projet CloneAdapt (Plant2Pro) coordonné par Philippe Gallusci (UMR EGFV). Le projet CloneAdapt vise à évaluer comment la diversité épigénétique induite par l'environnement peut contribuer à la résilience des plantes soumises à un stress ultérieur. Plus fondamentalement, il s’agit d’étudier comment l'environnement affecte l'épigénome des plants de vigne, quelle partie de ces changements épigénétiques est transmise après multiplication asexuée et pourrait être impliquée dans l'adaptation des plantes à leur environnement. Dans le stage considéré ici, il s’agira d’évaluer si des plantes stressées par l’environnement abiotique présentent une modification de sensibilité à un stress biotique, et plus particulièrement vis-à-vis du black rot.

Contexte:Le changement climatique fait peser de nombreuses menaces sur l'agriculture, y compris la viticulture, en générant divers types de stress intenses pour les plantes. En viticulture, des stratégies sont mises au point pour atténuer ces effets: des changements dans les pratiques de gestion des vignobles, la sélection de nouvelles variétés de vignes et/ou de porte-greffes mieux adaptés aux stress environnementaux. Des données récentes suggèrent que l'épigénétique (modifications héréditaires du fonctionnement du génome), pourrait jouer un rôle dans l'adaptation des plantes à leur environnement. Dans ce contexte, la vigne, plante vivace greffée et multipliée par clonage, offre l'occasion d'étudier comment les mémoires épigénétiques parentales induites par l'environnement peuvent être utilisées comme moteur pour l'adaptation rapide à l'environnement des descendants multipliés par clonage.Le black rot est quant à lui un champignon ascomycète qui est en recrudescence depuis quelques années dans plusieurs vignobles. Il devient une nouvelle priorité pour les viticulteurs, en particulier dans un contexte de réduction de solutions fongicides efficaces et du déploiement de variétés résistantes à l’oïdium et au mildiou, mais sensibles au black rot. Le black rot est hémibiotrophe (il a besoin de tissus en croissance pour se développer).

Objectif: Il s’agit ici de voir si des plantes ayant subi des stress abiotiques récurrents (stress hydrique et thermique) et possédant des marqueurs épigénétiques de ce stress présentent des modifications de leur sensibilité à des stress biotiques notamment à des champignons hémibiotrophes ou biotrophes (très sensibles à la croissance/physiologie des tissus).

Mission et activités: L’étudiant.e réalisera des biotests avec du black rot sur des boutures issues de plantes qui ont subi ou non des stress environnementaux (stress hydrique et thermique) sur plusieurs années. Les plantes mères auront été caractérisées pour leur marqueurs épigénétiques et leur croissance. Les plantes testées seront également caractérisées pour leur croissance et composition physiologique.

Techniques: Multiplication d’isolats in vitro, préparation de solutions de spores, biotests en serre, essais de biotests in vitro, caractérisation de développement et physiologie des plantes, quantification visuelle et par imagerie de la maladie, préparation des échantillons pour les analyses épigénétiques.


Formations et compétences recherchées

Licence/Master (Bac+3/5)

Master (Bac+3/5)

Formation recommandée: L3 à Master 2

Aptitudes recherchées: Capacité à travailler de manière autonome et en équipe, sens de l’observation, de l’organisation et de la gestion d’échantillons et de données.


Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à30 jours de congés+ 15 RTTpar an (pour un temps plein)
- d'un soutienà la parentalité : CESUgarded'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences: formation, conseilen orientation professionnelle ;
- d'un accompagnementsocial : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestationsvacancesetloisirs :chèque-vacances,hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activitéssportivesetculturelles ;
- d'unerestaurationcollective.


Modalités pour postuler

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Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr

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