Au sein de la Direction Recherche et Innovation, vous contribuez au développement et à l’amélioration de pipelines bioinformatiques dans un contexte de médecine personnalisée. Vous participez à la validation technique des méthodes développées et à l’analyse de données NGS. Vos principales missions sont les suivantes : Vous développez et améliorez les pipelines bioinformatiques : - Concevoir, optimiser et documenter des pipelines d’analyse de données de séquençage haut débit ; - Faire évoluer les workflows existants afin d’améliorer la détection et la priorisation de cibles d’intérêt thérapeutique ; - Intégrer de nouvelles approches analytiques au sein de pipelines modulaires et reproductibles. Vous analysez, optimisez et participez au benchmarking des méthodes : - Évaluer et comparer différentes méthodes et algorithmes d’analyse NGS ; - Réaliser des études de performance sur données internes et externes ; - Documenter les résultats et formuler des recommandations pour les projets de recherche et les applications cliniques. Vous exploitez et analysez des bases de données génomiques publiques. Vous menez des analyses NGS et participez à des projets transversaux : - Réaliser des analyses bioinformatiques sur données génomiques et transcriptomiques ; - Collaborer étroitement avec les équipes Biologie, Immunologie, Données et Clinique ; - Contribuer à l’industrialisation des workflows en vue d’un usage en environnement clinique. Vous possédez au minimum un bac5 en bioinformatique, biologie computationnelle ou discipline similaire ou une expérience équivalente. Vous avez de l’expérience dans l’analyse et l’interprétation de larges jeux de données de séquençage, idéalement dans un contexte d’immuno-oncologie. Vous maîtrisez l’environnement UNIX et les langages Python et R. Vous avez une bonne connaissance des bonnes pratiques de développement (versioning, workflows, conteneurisation, reproductibilité) afin de développer des outils robustes. Une familiarité avec des approches d’analyse immunogénomique ou de découverte de nouvelles cibles serait un plus. Un intérêt pour les problématiques liées aux biomarqueurs ou une expérience avec des données de type single‑cell serait apprécié. La maîtrise de l’anglais est indispensable (lecture d’articles, rédaction de rapports, présentations orales). Transgene est une société française qui conçoit et développe des immunothérapies innovantes contre les cancers, dont un vaccin thérapeutique individualisé. Nos candidats-médicaments visent à libérer le potentiel du système immunitaire du patient pour lui redonner les moyens de lutter contre la maladie.
En cliquant sur "JE DÉPOSE MON CV", vous acceptez nos CGU et déclarez avoir pris connaissance de la politique de protection des données du site jobijoba.com.