Stage - suivi population de cistude d’europe de la reserve naturell...

Contexte du recrutement et définition de poste :

Contexte

Située dans l’anse nord du Bassin d’Arcachon, la Réserve Naturelle Nationale des prés salés d’Arès et de Lège-Cap Ferret, cogérée par l’association Arpège et l’Office Français de la Biodiversité couvre une superficie de 330 ha dont 200 ha sont composés de prés salés. Créée en 1983 afin de préserver la richesse floristique de la plus grande zone de pré salé de l’ex-région Aquitaine, cette réserve naturelle comprend également un domaine endigué, correspondant à d’anciens réservoirs piscicoles bordés d’une zone bocagère.

Ces anciens réservoirs, appelés communément "réservoirs à poissons" ont vu l’abandon de l’élevage piscicole et se sont renaturés spontanément. Ils sont rattachés aujourd’hui à des habitats naturels d’intérêt communautaire prioritaire en tant que « lagunes côtières en mer à marées ». Alimentés à la fois en eau douce par l’amont via le ruissellement de surface, et en eau salée par l’aval via les marées venant du bassin d’Arcachon, par l’intermédiaire de trois écluses, ils représentent une zone de croissance pour l’ichtyofaune et abritent une faune et une flore patrimoniales : Loutre d’Europe, herbiers de Ruppie, tapis de characées ainsi qu’une population de Cistude d’Europe.

Cette dernière est ainsi présente sur le site au sein du complexe endigué, sur une grande partie des réservoirs en eau douce ou saumâtre. On retrouve également une population ou plusieurs sous-population (non caractérisées) au nord, le long du canal des Étangs, le long du ruisseau de la Machinotte, ainsi que dans le marais des Agaçats et le lac de Bénédicte, tous deux classés Espaces Naturels Sensibles (ENS) et gérés par le Syndicat Intercommunal d’Aménagement des Eaux du Bassin Versant des Etangs du Littoral Girondin (SIAEBVELG).

La population présente dans la réserve naturelle constitue un enjeu de gestion à part entière inféodé aux perspectives de gestion actuelle et future du site et de ce domaine endigué.

Une première étude sur la Cistude d’Europe a été menée en 2009 (Pageault., 2010). Elle a permis de mettre en place une méthode de suivi de la population avec la définition de plusieurs itinéraires de prospection sur des zones de thermorégulation de l’espèce. Ce premier dénombrement a permis d’estimer à l’époque un effectif maximal de 42 individus distincts.

Non reconduite par manque de temps et de moyens humains, l’étude a laissé place à un suivi empirique par dire d’expert entre 2010 et 2013 : observation régulière d’individus sur la partie nord des anciens réservoirs ainsi que des restes de pontes prédatées et/ou écloses.

Par la suite, deux campagnes distinctes de Capture-Marquage-Recapture (CMR) ont été effectuées en 2015 et 2018 (Nicole T, 2015 ; Even C, 2018). Au total, 126 individus différents ont été marqués lors de ces deux campagnes. Des analyses de taille, des paramètres démographiques de la population ont ainsi été réalisées permettant une description et une estimation plus précise de la population fréquentant le site.

La reconduite d'une campagne de CMR sur la Cistude d’Europe permettra de réévaluer la population en place comparativement aux résultats acquis lors des deux précédentes campagnes. Au regard des résultats attendus (nouvelle estimation de population, évaluation de la dynamique de population, taux de recapture, état sanitaire (visuel)), nous souhaiterions pouvoir émettre des perspectives afin de définir et planifier dans notre futur plan de gestion une stratégie de gestion à conduire sur cette espèce en particulier, et plus largement sur ce complexe endigué.

En effet, au-delà de la présence de cette espèce patrimoniale, le domaine endigué, isolé artificiellement du bassin d’Arcachon par une digue, est directement concerné voire menacé par l’élévation du niveau des mers et le changement climatique (submersions lors de tempête, rupture potentielle de digue, fortes évaporations estivales, augmentation des températures, baisse de l’oxygène dissous et développement algal, fortes salure/dessalures). La gestion hydraulique menée jusqu’à présent sur ce domaine a permis d’améliorer les continuités hydrauliques avec le bassin d’Arcachon, et a initié un travail d’adaptation du milieu aux risques climatiques. Ce travail est à poursuivre et à planifier dans le cadre de la mise à jour du plan de gestion de la réserve naturelle pour 2026-2035. Il tiendra compte d’une part de l’enjeu espèce en favorisant par exemple les corridors écologiques entre la RNN et les zones humides périphériques, et d’autre part de l’enjeu habitats naturels et adaptation au changement climatique.

De manière complémentaire à cette campagne sur la réserve naturelle, une CMR sera également menée (via un stage) par l’association Cistude Nature pour le compte du Siabvelg, pour la première fois sur le marais des Agaçats, marais retro-littoral périphérique à la réserve naturelle. Ce marais semble en effet accueillir une belle population de cistudes et pourrait à terme devenir un site de repli pour une partie de la population de la réserve naturelle dans un contexte de maritimisation du domaine endigué. Profitant de ces campagnes de CMR menées sur ce site ainsi que sur celui de la RNN, l’association Cistude Nature prévoit d’équiper certains individus de balises GPS et émetteur, afin de suivre les déplacements et relever les points stratégiques. Le stage réalisé sur la réserve naturelle pourra donc être fait en partie en binôme avec celui sur le marais des Agaçats.

S’agissant d’une espèce protégée, les autorisations de capture sont requises pour réaliser ces études (CMR et télémétrie). L’autorisation de capture pour la RNN est valide, celle pour le marais des Agaçats est en cours de demande et d’obtention.

Objectifs du stage :

1. Réalisation d’une nouvelle campagne terrain de Capture - Marquage - Recapture sur le Cistude d’Europe sur le site de la réserve naturelle nationale des Prés salés d’Arès Lège-Cap Ferret.
2. Suivi d’une analyse statistique des données collectées lors de cette campagne et lors des campagnes précédentes (analyse comparative, biostatistiques).
3. Définition des orientations de gestion pour cette espèce et pour le domaine endigué.

Missions du stagiaire H/F

4. Compilation et synthèse des données et connaissances naturalistes connues sur l’espèce de manière générale mais aussi locale (données connues du gestionnaire, des partenaires institutionnels scientifiques et techniques de la réserve naturelle, recherches bibliographiques, etc.) ;
5. Conduite dans sa globalité de la campagne de CMR sur la RNN comprenant 3 sessions de capture d’une semaine chacune sur le site ; 72 points d’échantillonnage par session (nasses appâtées) ;
6. Appui à la réalisation de la campagne de CMR menée sur le marais des Agacats par Cistude Nature ;
7. Suivi des individus éventuellement équipés de balises GPS (recherche des individus équipés) ;
8. Saisie des données et gestion de la base de données Cistude de la RNN ;
9. Réalisation d’une analyse statistique descriptive sur la base des données collectées en 2026 mais aussi d’une analyse comparative avec les données collectées en 2015 et 2018 ;
10. Réalisation d’une cartographie des déplacements des individus équipés de balises ;
11. Recherche, cartographie de sites de ponte sur le site et en périphérie de la RNN. Caractérisation de ces derniers (superficie, nature du substrat, végétation, tendance évolutive, indices de prédation, etc…).
12. Rédaction d’un rapport d’analyse de la campagne 2026, avec réflexion sur la gestion à mener, préconisations d’objectifs et d’actions pour le plan de gestion.

Ces différentes missions se feront sous la direction du conservateur de la réserve naturelle ainsi qu’en lien et avec l’expertise du Siabvelg et de l’association Cistude Nature pour ce qui est de la campagne de CMR menée sur le marais des Agaçats et l’équipements et le suivi des individus équipés.

Conditions de stage

Durée du stage : six mois

Période : de janvier- février à juillet-août

Structures d’accueil : Association ARPEGE

Localisation :

Bureau : Siège de l’association Arpège, 33950 Lège-Cap Ferret

Terrain : Périmètre de la Rnn, zone des Abberts et marais des Agaçats

Hébergement : à la charge du stagiaire

Rémunération : rémunération légale 2026

Frais : prise en charge des frais de déplacements selon les taux en vigueur

Prospections de terrain et campagnes CMR réalisées dans des conditions de terrain difficile (fort envasement, accessibilité difficile),

Candidatures :

Profil recherché :

Profil souhaité :

13. Goût prononcé pour les prospections de terrain,
14. Bonnes connaissances sur la gestion des écosystèmes aquatiques et des corridors écologiques,
15. Bonnes connaissances en statistique et maitrise des outils d’analyses,
16. Connaissances naturalistes générales,
17. Bonne connaissance et maitrise des méthodes et outils SIG,
18. Esprit de synthèse et qualités rédactionnelles,
19. Une expérience en capture et marquage d’animaux serait un plus,
20. Rigueur pour l’application d’un protocole standardisé comprenant notamment la capture et le marquage d’animaux (bien-être animal, protocole sanitaire, etc.)