Situé dans une ville attractive, proche du bassin d'Arcachon et des Pyrénées, premier employeur de Nouvelle-Aquitaine, classé parmi les premiers au classement des CHU de France, le Centre hospitalier universitaire de Bordeaux assure ses missions de soin, de recherche, d'enseignement et de prévention au bénéfice de la population de la Métropole de Bordeaux et de sa région environnante.
Fort de 14500 agents et plus de 180 métiers, il regroupe ses activités sur trois sites hospitaliers, les groupes hospitaliers Pellegrin et Saint-André à Bordeaux et le groupe hospitalier Sud à Pessac. Etroitement liés à l'Université de Bordeaux, ils participent de manière constante à la formation médicale, chirurgicale, pharmaceutique et odontologique de la région ainsi qu'à la recherche fondamentale en liaison avec les unités INSERM et CNRS avec des nouvelles techniques innovantes.
Situé à Bordeaux, proche de Mérignac, le Groupe Hospitalier Pellegrin est le plus important des sites du CHU de Bordeaux. Il constitue un centre de soins aux compétences et équipements très étendus. Le CHU de Bordeaux recrute un(e) Gestionnaire de Données Biomédicales au sein des services de Service de Néphrologie-Transplantation et Service de Pneumologie
La transplantation constitue une priorité nationale reconnue par le code de santé publique. Il s'agit
d'une thérapeutique sans équivalent à ce jour pour traiter la maladie chronique au stade de
suppléance. Elle est actuellement portée par un plan ministériel 2 pour favoriser son
développement. Il s'agit également d'une discipline de recours hospitalo-universitaire. Ainsi, à titre
d'exemple, le nombre de greffes rénales a plus que doublé en 20 ans en Aquitaine passant de 78 greffes en 2002 à 205 greffes en 2022. Le nombre de patients inscrits par an est passé de 143 en 2008 à 265 en 2022 et le nombre total de patients inscrits sur liste est passé de 239 en 2008 à 908 en 2022.
Les transplantés d'organe solide sont à risque d'infections communautaires et opportunistes
impactant leur survie. Ainsi, à titre d'exemple, les infections représentent la principale cause de
décès dans l'année suivant une transplantation cardiaque ou pulmonaire, représentant 32% et 35%
respectivement.
Le projet SOT BIG (Solid Organ Transplantation - Bordeaux Infectious Group) propose la structuration d'une base de données épidémiologique homogène de tous les
patients transplantés d'organe solide du CHU de Bordeaux tout en intégrant les spécificités de chaque
organe.
Cette structuration passera par la constitution d'une base de données dédiée dans
l'environnement de l'entrepôt de santé (EDS) qui inclura les patients adultes receveurs d'une greffe
d'organe solide. La base nécessitera également une fusion des données de l'EDS avec les données de
l'Agence de biomédecine (ABM) et les bases de données déjà constituées dans certains services (base
de données sur les infections opportunistes ; base de donnée issue du logiciel RAN; dossier
informatisé régional des patients transplantés rénaux), avec une actualisation régulière de ces bases.
Cette base pourra ponctuellement être croisée avec les données du SNDS en fonction des projets.
Les travaux de recherche clinique s'articuleront autour de 3 axes :
- Un axe de prévention en lien avec le SNDS : délivrance d'anti-infectieux utilisés à titre
prophylactique afin d'en estimer l'observance, couverture vaccinale avant et après
transplantation.
- Un axe de veille épidémiologique : évolution de la résistance aux anti-infectieux mais aussi du
risque infectieux émergent dérivé ou non du donneur.
- Un axe de suivi du risque infectieux post greffe à l'ère de nouveaux immunosuppresseurs tels
que l'imlifidase récemment recommandé en transplantation rénale pour certains patients
hyperimmunisés.
.Le gestionnaire créera notamment, avec l'aide des ARC du service, un eCRF REDCAP destiné au recueil des données pour les patients éligibles à l'Imlifidase et/ou traités par imlifdase au moment de la greffe (Etude ISKIA). Ce recueil national concernera une vingtaine de centres et des extractions annuelles sur certaines données (retour en dialyse, décès, réinscription sur liste de greffe) devront être réalisées.
Mission générale :
Assurer le regroupement et le traitement des données de recherche clinique recueillies. Elaborer des bases de données. Contrôler la cohérence et la qualité des données. Elaborer des bases de données, en conformité avec les exigences réglementaires et les transmettre pour exploitation.
Principales activités :
- Conception et rédaction (et validation) de documents techniques, relatifs au domaine d'activité
- Contrôle de la cohérence des données / informations spécifiques au domaine d'activité
- Contrôle de la conformité des résultats au regard du cahier des charges, des spécifications, coûts, performances, délais
- Contrôle des données / documents relatifs à son domaine
- Élaboration et mise en place de l'architecture technique des serveurs et des bases de données du système d'information
- Organisation / coordination / supervision des contrôles relatifs aux activités du secteur, de l'unité
- Organisation / coordination / validation des activités du secteur, de l'unité
- Organisation et description des processus spécifiques à son domaine, traitement des dysfonctionnements
- Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d'activité
- Programmation des outils d'automatisation
- Recueil / collecte de données ou informations spécifiques à son domaine d'activité OU Recueil / collecte et/ou paramétrage de données ou informations spécifiques provenant d'autres systèmes d'information
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