Ingénieur d'études biologiste en traitement des données (h/f)

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5096-OLIPAN-001 Date de début de diffusion 25/03/2026 Date de parution 28/03/2026 Date de fin de diffusion 15/04/2026 Intitulé long de l'offre Ingénieur d'études biologiste en traitement des données (H/F) Date limite de candidature 15/04/2026 Nature du contrat CDD d'1 an Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en biologie - SVT Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur d'études biologiste en traitement des données (H/F) Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : Au cours de cette mission vous participerez à l’analyse bioinformatique de la dynamique du génome dans des plantes soumises à des stress environnementaux pour mieux comprendre l’adaptation des plantes au changement climatique. Activités : • Vous serez en charge de la caractérisation des variants structuraux à partir de données de séquençage Nanopore dans une population de hêtres, dans le cadre du projet PEPR "Tools for Adapt" • Vous participerez à l’assemblage de génomes de hêtre à partir de données ProméthION Nanopore et à la réalisation d'un pan-génome de la population étudiée. • Vous contribuerez à améliorer des outils et pipelines dédiés à l’analyse et à l’assemblage des ADNecc et des SV. Contexte de travail : L’équipe mixte de recherche EMR269 « MANGO » s’intéresse aux mécanismes génomiques de l’adaptation chez les plantes, il s’agit d’une équipe mixte entre l’IRD, le CNRS et l’Université de Perpignan. Elle fait partie du Laboratoire « Génome et Développement des Plantes » et est basée sur le campus de l’Université de Perpignan. L’EMR MANGO travaille sur plusieurs modèles végétaux (Arabidopsis, hêtre, riz, inule) et se caractérise par le développement de protocoles adaptés à l’utilisation des lectures longues Nanopore pour la génomique et la transcriptomique ainsi que le développement d’outils bioinformatiques dédiés. L’équipe est financée par des projets ANR ainsi que par le Labex TULIP. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : • Maitrise des outils bioinformatiques pour l'analyse des données NGS. • Expérience d’utilisation de données génomiques en lectures longues (Nanopore par exemple). Une expérience en variations structurales serait un plus. • Très bonnes capacités rédactionnelles et aisance à l’oral. • Capacités relationnelles et interculturelles. • Capacités organisationnelles. • Niveau de maitrise de l'anglais C1-C2. Contraintes et risques : Travail sur un poste informatique. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) A partir de 2521,95 € brut mensuel, ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des p Localisation du poste Europe, France, Occitanie, Pyrénées Orientales (66) Géolocalisation du poste PERPIGNAN Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 66860 PERPIGNAN (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 6 Licence/diplômes équivalents Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français (Seuil)