Data manager

Vos missions en quelques mots La personne recrutée en tant que Data manager aura pour mission d’assurer la gestion, l’harmonisation et la valorisation des données multi-omiques issues des projets NeuroDINet/NeuroDIP afin de soutenir les recherches sur les maladies neuroinflammatoires telles que la sclérose en plaques (SEP), la neuromyélite optique (NMOSD) et la maladie associée à l'anticorps MOG (MOGAD). Le/la Data Manager aura pour objectif de centraliser et structurer les données, garantir leur conformité réglementaire et éthique, créer une base de données harmonisée adaptée aux analyses multi-omiques et faciliter leurs exploitations scientifiques pour répondre aux enjeux de la médecine personnalisée. Les données proviendront de patients atteint de pathologies neuroinflammatoires mais également de leurs familles de toute la France. Activités principales Structurer et centraliser les données : Collecter, organiser et intégrer des données de patients (et leurs familles) provenant de multiples sources, y compris des biocollections et collaborations nationales, dans une base harmonisée adaptée aux analyses multi-omiques. Utiliser des outils spécialisés en gestion de bases de données relationnelles (ex. REDCap). Formaliser et mettre en œuvre des processus de data management multi-projet, notamment : spécification des outils de collecte automatisée (API), création des maquettes pour le recueil de données (CRF), implémentation des systèmes de saisie électronique (eCRF), et rédaction des documents clés tels que le Plan de Gestion des Données (PGD) et les procédures associées. Garantir la conformité réglementaire et éthique : Mettre en œuvre les bonnes pratiques de gestion des données en respectant les cadres légaux (notamment le RGPD) et les exigences éthiques liées aux études génomiques. Veiller à la traçabilité et à la qualité des données. Collaborer à l’élaboration de pipelines d’analyse : Travailler avec les bioinformaticiens et les chercheurs pour concevoir et optimiser les workflows nécessaires à l’exploitation des données, en intégrant des outils d’analyse innovants. Mettre en place des stratégies de stockage et de sécurisation des données Développer et implémenter des solutions techniques pour garantir la sécurité, la sauvegarde, et l’archivage pérenne des données sensibles. Superviser le nettoyage et la mise en qualité des données collectées, incluant le recodage, le traitement des incohérences, la revue des données, les contrôles qualité, le gel des bases, et les exports ponctuels à la demande. Valoriser les données pour les publications et la diffusion scientifique : Préparer les jeux de données pour leur intégration dans des entrepôts collaboratifs ou publics, et fournir un soutien aux chercheurs pour la documentation et la communication des résultats. Profil recherché • Formation et/ou qualification : Diplôme de niveau Bac5 ou équivalent en bioinformatique, biostatistique, informatique appliquée à la recherche, ou disciplines connexes. • Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : - Expérience (4/5 ans) dans le domaine du data management dans le secteur clinique / recherche - Expérience pratique avec des bases de données relationnelles (PostgreSQL, MySQL, REDCap ou équivalent) et des outils de bioinformatique (e.g., R, Python, …). - Collaboration avec des équipes pluridisciplinaires, incluant chercheurs, bioinformaticiens et cliniciens. Poste ouvert aux agents susceptibles de se prévaloir d’une priorité légale conformément aux dispositions de l’article L.512-19 du Code Général de la Fonction Publique (sur présentation d’un justificatif). Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents Compétences attendues Compétences et connaissances requises Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires : - Anglais professionnel requis - Solides connaissances en gestion de bases de données et, si possible, en analyse de données multi-omiques - Maîtrise des méthodologies de structuration et harmonisation des données cliniques, biologiques et génomiques (ex. REDCap) - Connaissance des réglementations en matière de protection et de gestion des données sensibles (e.g., RGPD, éthique de la recherche) - Familiarité avec les outils et logiciels de bioinformatique (ex. R, Python, plateformes d'analyse de données génomiques) - Maitrise des outils de data management : e-CRF, catalogue des données, gestion des métadonnées. - Aisance avec les outils informatiques (e-CRF, outil de versioning Git, …) - Bonne capacité d'analyse et de rédaction de documents clairs et précis à communiquer à tout niveau (rapports/procédures) Savoir-faire opérationnels : - Concevoir et maintenir des bases de données relationnelles adaptées aux besoins d'analyse - Participer à la mise en œuvre des pipelines d'analyse pour les données génomiques, en collaboration avec les chercheurs et bioinformaticiens - Garantir la sécurité, la traçabilité et la qualité des données tout au long de leur cycle de vie - Préparer les données pour leur valorisation scientifique et leur diffusion dans des entrepôts publics ou collaboratifs - Adapter les outils et méthodes aux spécificités des projets de recherche Savoir-être : - Rig Localisation Localisation : 1, quai de Tourville 44035 Nantes Flèche gauche : déplacer la carte vers la gauche Flèche droite : déplacer la carte vers la droite Flèche bas : déplacer la carte vers le bas Flèche haut : déplacer la carte vers le haut