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Data steward - standardisation des données cliniques (omop-cdm) /x f/h

Paris
Institut Pasteur
Publiée le Il y a 7 h
Description de l'offre

Votre mission : donner du sens aux données pour accélérer la découverte En particulier, vous superviserez la gestion des données cliniques de deux projets d'envergure :. EVH (European Vaccine Hub) : consortium européen créant des synergies entre les meilleures expertises en vaccinologie européennes via la mise en place d'un continuum allant de la recherche la plus fondamentale jusqu'aux essais cliniques, en partenariat avec les entreprises productrices de vaccins.. Un consortium français visant à développer notre compréhension des mécanismes et trajectoires de maladies chroniques Nous recherchons un(e) candidat(e) qui aime structurer, organiser des projets complexes et faciliter la gestion des données entre équipes internationales. Ce que vous ferez concrètement. Définir les règles de gestion et de qualité des données pour les deux consortiums en vous assurant que chaque partenaire les connaisse et soit en capacité de les appliquer.. Collaborer étroitement avec les investigateurs cliniques, les biostatisticiens et les responsables IT pour comprendre les spécificités des données EVH et celles du deuxième consortium (p. ex. données Omiques) et sensibiliser à la bonne gestion des données. Concevoir et implémenter des workflows pour convertir les données des 2 projets vers le modèle OMOP-CDM et plus largement accompagner la plateforme de Data Management de l'Institut pasteur à standardiser vers ce format. Former les membres des consortiums et les chercheurs de l'Institut Pasteur au format OMOP-CDM. Assurer la qualité des données transformées et valider les droits d'accès et de partage en fonction des besoins des projets et de la réglementation. Mapper les données sources vers les vocabulaires standardisés internationaux (SNOMED CT, LOINC, RxNorm, ICD-10). Documenter les processus. Contribuer au partage de données des 2 projets dont vous aurez la charge. Participer au développement de la communauté OMOP-CDM (conférences, workshops) Votre profil : entre expertise clinique et appétence pour la standardisation. Vous avez une première expérience avec OMOP-CDM (même ponctuelle : un mapping de tables, une participation à un workshop OHDSI) et vous souhaitez monter en puissance sur ce standard devenu incontournable. Vous avez une vraie culture recherche clinique, vous comprenez les contraintes et les exigences de la gestion des données de recherche en santé. Vous maîtrisez R ou Python et SQL ; la connaissance des bases de données type PostgreSQL est un plus. Vous êtes rigoureux(se), curieux(se) et convaincu(e) par l'idée que les données bien standardisées accélèrent la recherche translationnelle. Vous êtes à l'aise pour évoluer dans un environnement multiculturel et communiquer en anglais (niveau C1). Vous aimez communiquer, faire circuler l'information pour que chaque partenaire de projet comprenne les enjeux ou process de gestion des données Vos conditions et environnement de travail : L'Institut Pasteur s'engage à offrir un environnement de travail inclusif et respectueux. Nous accueillons toutes les candidatures répondant aux critères du poste, en valorisant la diversité sous toutes ses formes et les parcours variés. - Politique de congés et RTT très favorable (Forfait 204 jours) - Possibilité de télétravail - Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport - Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias - Mutuelle familiale (gratuité conjoints/enfants) et service de santé pour les collaborateurs sur le campus - Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives sur le campus - Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées - Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités sur le campus). L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans. Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur. Nous recherchons un(e) Data Steward pour accompagner sa transformation vers la standardisation de ses données de santé. Au sein de la Plateforme de Data Management, (9 data managers, 2 data stewards) vous serez le(la) référent(e) de la transformation, de la qualité et de l'interopérabilité de nos données cliniques en les standardisant au format OMOP-CDM (Common Data Model de l'Observational Health Data Sciences and Informatics - OHDSI). Vous accompagnerez nos équipes de recherche à l'utilisation de ce format et pourrez être impliqué(e) plus largement dans la gestion des données de recherche biomédicale, cliniques et pré-cliniques.

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