Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques h/f

Informations générales

Réservé aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI) et aux fonctionnaires et CDI de droit public
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques H/F
Référence : UMR5089-MOBINT-P53014
Lieu de travail : TOULOUSE
Institut : INSB - Institut des sciences biologiques
Date de publication : mercredi 3 décembre 2025
Session : Campagne Hiver 2026
Groupe de Fonction : IEG3
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingenieure ou ingenieur en experimentation et instrumentation biologiques

Missions

Sous la direction des responsables de l'équipe protéomique et de la plateforme protéomique à l'IPBS,
l'ingénieur-e conduira et développera des stratégies d'analyses protéomiques à large échelle afin de
gérer en autonomie des projets collaboratifs de recherche en biologie et santé et de répondre aux
enjeux récents du domaine, comme la protéomique de la cellule unique.
Il/elle mettra également en œuvre et adaptera différentes méthodes de spectrométrie de masse (MS)
structurale pour l'analyse de protéines telles que la protéomique top-down, la MS native l'échange
hydrogène-deutérium couplé à la spectrométrie de masse et la photométrie de masse.

Activités

ACTIVITÉS PRINCIPALES :

- Assurer la mise en œuvre des différentes méthodes de MS implémentées sur la plateforme
(Bottom-Up MS, Top-Down MS, MS native, HDX-MS et photométrie de masse) et le traitement
bioinformatique des données MS (recherche en banques de données, analyse quantitative des données et
analyse structurale à l'aide de logiciel dédiés).
- Rechercher et définir, en fonction de chaque système protéique étudié, la ou les méthode(s)
d'analyse adaptée(s).
- Définir et mettre au point les protocoles expérimentaux et processus de traitement des
échantillons (enrichissement, dessalage, .
- Interpréter et présenter les résultats d'analyse.
- Rédiger les rapports d'analyse, les notes techniques et les protocoles de mise en œuvre des
méthodes d'utilisation des spectromètres de masse.
- Contrôler, calibrer, nettoyer régulièrement les spectromètres de masse et gérer les
opérations de maintenance.
- Appliquer la démarche qualité de la plateforme, piloter et participer à l'amélioration
continue des processus qualité.
- Assurer la formation et l'encadrement des utilisateurs (étudiants, personnel non-



ACTIVITÉS ASSOCIÉES :
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques (rapports, brevets,
publications, présentations orales)
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité
- Animer des réseaux professionnels d'échange de compétences
- Appliquer et faire appliquer les règles en hygiène et sécurité et leur évolution.
- Assurer des actions de formation (cours, TP, écoles thématiques et ateliers sur la MS).
- Gérer des commandes

Compétences

Connaissances/savoirs fondamentaux :
- Acquisition et traitement des données protéomiques par spectrométrie de masse (connaissance
approfondie)
- Informatique appliquée (connaissance approfondie)
- Spectrométrie de Masse Structurale (connaissance approfondie des différentes méthodes).
- Biologie / Chimie / Biochimie des protéines (connaissance approfondie)
- Biologie Structurale.
- Outils mathématiques et informatiques nécessaires à l'exploitation des résultats de MS
structurale.
- Concepts de qualité appliqués aux techniques de spectrométrie de masse.
- Techniques séparatives et de préparation d'échantillons protéiques et peptidiques
(purification, dessalage,
- Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité et risques professionnels (chimiques,
électriques, .
- Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)


Compétences opérationnelles :
- Maîtriser les méthodes biochimiques et les techniques séparatives des protéines et des
peptides (lyse cellulaire, dosage, fractionnement HPLC, purification par affinité, dessalage,
digestion enzymatique,
- Maîtriser les méthodes d'acquisition et les outils informatiques de pilotage des
spectromètres de masse pour l'analyse des peptides et protéines (Excalibur, Data Analysis, MassLynX)
- Maîtriser les logiciels de traitements des données MS en protéomique quantitative et MS
structurale (MaxQuant, ProteomeDiscoverer, DIANN, Spectronaut, et les méthodes d'analyses
statistiques
- Appliquer les techniques de maintenance des appareils et garantir la qualité des données
acquises
- Mettre en œuvre la démarche qualité (ISO9001, NFX 50-900)
- Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité
- Maîtriser l'utilisation des outils de recherche bibliographique
- Transmettre des connaissances
- Interagir avec l'ensemble des interlocuteurs (collaborateurs, équipe, SAV)

Contexte de travail

L'IPBS regroupe des équipes de biologistes dans les domaines du cancer et des maladies infectieuses,
qui utilisent la protéomique et la spectrométrie de masse (MS) structurale pour caractériser et
valider de nouvelles voies et cibles thérapeutiques. La personne recrutée intégrera l'équipe
Protéomique et Spectrométrie de Masse des Biomolécules (22 membres), qui héberge la plateforme
protéomique de Toulouse (, label IBiSA, normes ISO9001/NFX 50-900, intégrée au
réseau local des plateformes Génotoul), et constitue un des trois nœuds fondateurs (huit nœuds
aujourd'hui) de l'Infrastructure Nationale de protéomique, ProFI. L'équipe mène des recherches en
protéomique à large échelle et en MS structurale et répond aux besoins de la communauté scientifique
en biologie, santé et agrobiosciences.

L'ingé recruté.e jouera un rôle clé dans l'organisation de l'équipe et contribuera activement
aux actions menées par ProFI. Il/Elle appliquera toutes les étapes des approches de protéomique à
large échelle et/ou de MS structurale, de la préparation des échantillons à l'analyse
bioinformatique des données. Il/Elle mettra en œuvre et optimisera les techniques nano- et micro-
chromatographiques pour la séparation de peptides et protéines, ainsi que les méthodes d'acquisition
MS sur les divers instruments du parc (Orbitrap Q-Exactive, Fusion, Exploris et Q-TOF TimsTOF,
SynaptG2Si). Il/Elle participera aux développements récents de la protéomique en cellule unique, de
l'immunopeptidomique et des méthodes de MS structurale (top-down MS, MS native, HDX-MS).
Il/Elle travaillera en collaboration avec les biologistes/structuralistes pour exploiter les données
et répondre aux problématiques biologiques.