Mission :
Dans le cadre du projet SuPrTrYp (PEPR BBEST), il s'agira de développer, mettre en place et comparer des outils de prédiction automatique des fonctions enzymatiques de gènes de levures par apprentissage profond, notamment pour les gènes impliqués dans les voies métaboliques du tryptophane.
Activités :
- Déploiement des différents outils existants de prédiction de fonctions enzymatiques pour leur application à l'annotation de gènes de levures
- Développement, entraînement et déploiement d'un nouvel outil dans la continuité du prototype EnzBERT développé par notre équipe
- Évaluation et comparaison des performances des différents outils de prédiction
- Spécialisation des meilleurs outils pour la prédiction de gènes d'intérêt impliqués dans les voies métaboliques du tryptophane
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