Ingénieur de recherche h/f

Entreprise

Née de la volonté conjuguée d’universités, de grandes écoles et d’organismes de recherche, l’Université Paris-Saclay compte parmi les grandes universités européennes et mondiales, couvrant les secteurs des Sciences et Ingénierie, des Sciences de la Vie et Santé, et des Sciences Humaines et Sociales. Sa politique scientifique associe étroitement recherche et innovation, et s’exprime à la fois en sciences fondamentales et en sciences appliquées pour répondre aux grands enjeux sociétaux. Du premier cycle au doctorat, en passant par des programmes de grandes écoles, l’Université Paris-Saclay déploie une offre de formation sur un large spectre de disciplines, au service de la réussite étudiante et de l'insertion professionnelle. Elle prépare les étudiants à une société en pleine mutation, où l’esprit critique, l’agilité et la capacité à renouveler ses compétences sont clés. L’Université Paris-Saclay propose également un riche programme de formations tout au long de la vie. Située au sud de Paris sur un vaste territoire, l'Université Paris-Saclay bénéficie d’une position géographique favorisant à la fois sa visibilité internationale et des liens étroits avec ses partenaires socio-économiques - grands groupes industriels, PME, start-up, collectivités territoriales, associations...

Site web : https://www.universite-paris-saclay.fr/fr

Etablissement handi-accueillant et attaché à la mixité et à la diversité

* De nombreuses activités culturelles et sportives sont proposées et accessibles facilement pour tout collaborateur dans le cadre de la politique de bien-être au travail développée à l’Université Paris-Saclay.
* Des possibilités de restauration proches des lieux de travail.
* Un accompagnement des agents pour leur développement professionnel et la préparation aux concours de la fonction publique
* Deux jours hebdomadaires de télétravail possibles sous certaines conditions.

Poste

L'unité UMRS1310 est rattachée à la commission CSS2 Cancer de l’Inserm, et fait suite à l’unité U935 créée en 2009, renouvelée à la vague E en une mono-équipe dirigée par le Pr A. Turhan qui étudie les mécanismes de résistances des cellules souches cancéreuses et stratégies innovantes thérapeutiques dans les cancers et leucémies. L'U1310 a bâti au cours des précédentes années une expertise internationale dans le domaine des cellules souches embryonnaires (CSE) et pluripotentes induites (iPSC). L’équipe développe des modèles physiopathologiques d’hémopathies malignes et cancers héréditaires. L’unité est pionnière dans la génération d’organoïdes 3D de cancers à partir de l’ingéniérie des cellules iPSC issues de patients porteurs de mutations oncogéniques. Ces modèles innovants miment les cellules souches tumorales et reproduisent l’hétérogénéité génétique des cancers.


Ces outils ont pour double objectif :


1/ la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques par une approche génomique et bio-informatique. Nous avons ainsi identifié des biomarqueurs pronostiques et théranostiques pour des thérapies ciblées et immunothérapies actives, par des approches innovantes vaccinales, dans les leucémies aiguës, les cancers du poumon non à petites cellules et les cancers du sein.


2/ la conception de stratégies d’immunothérapies cellulaires et géniques, utilisant les cellules de l’immunité innée et adaptative dérivées des iPSC, qui expriment des nouveaux CAR (Récepteurs Antigéniques Chimériques) identifiés dans l’unité.


Ces projets scientifiques sont conjointement réalisés avec l’UMS45 CITHERA, créée et labélisée en 2020 par le dispositif PIA-4 France 2030 dirigée par le Pr Annelise Bennaceur-Griscelli, qui coordonne l’infrastructure INGESTEM ( www.ingestem.org) « Cellules souches pluripotentes induites et ingénierie tissulaire ». La plateforme a mis au point les technologies les plus récentes d’ingénierie du génome pour transformer de manière stable et efficace les iPSC et dérivés cellulaires par les systèmes CRISPR / CAS9 en vue de produire de façon standardisée les cellules de l’immunité T NK CD et Macrophages pour les programmes de thérapies cellulaires dans les cancers.
Nos activités translationnelles sur ces programmes communs lient naturellement l’U1310 à l’UMS CITHERA dans le cadre du grand défi ‘Biothérapie – Bioproduction’ France 2030, allant de la recherche pré-clinique expérimentale à la bioproduction pour des futures phases cliniques précoces.


Missions de l’agent·e :

1.Responsable de l’Ingénierie Cellulaire et génomique des cellules souches pluripotentes

* Assurer les nouvelles technologies d’édition du génome par différentes approches (Crispr Cas9,
nouveaux vecteurs, ARNm) ;
* Travailler en équipe pour différents projets de l’u1310 et la communauté scientifique ;
* Amplification de lignées/clones iPSC qualifiés de grade recherche à partir de cellules somatiques humaines normales et pathologiques (patients) et animales ;
* Transformation génétique des cellules iPSC ou progéniteurs /organoïdes d’intérêt pour :
- corriger une mutation et générer une lignée iPSC et dérivés cellulaires isogéniques comme tissu témoin
- introduire une mutation ponctuelle et modéliser un variant moléculaire d’une pathologie
- intégrer des systèmes rapporteurs dans le génome d’une lignée d’iPSC ou dérivé cellulaire pour suivre un processus cellulaire ou moléculaire ou cribler des chimiothèques sur un phénotype d’intérêt
- modifier l’expression d’un gène (activation ou répression)
* Introduire de nouvelles séquences fonctionnelles (ex : récepteurs synthétiques, CAR) dans les IPSC en vue de la production de cellules NK, Lymphocytes T, cellules dendritiques, et macrophages ;
* Caractérisation moléculaire des clones iPSC selon les tests standards internationaux et tests sécuritaires (Introduction de gènes suicides, analyses des Off-targets).


2.Réaliser la veille scientifique et technologie des outils d’ingéniérie cellulaire et génomique


3.Formation des étudiants

Accompagner les étudiants dans leur projet au sein de l’équipe

4.Réaliser les tâches collectives pour le bon fonctionnement du laboratoire

* Gestion de la banque commune des IPSC grade recherche ;
* Prendre la responsabilité de certains équipements du laboratoire avec le suivi des maintenances ;
* Participer à la gestion des échantillons de la banque des IPSC en lien avec les outils développés par CITHERA dans un soucis de traçabilité des ressources biologiques.


5.Participer à la vie scientifique du laboratoire

* Bibliographie, cours, présentation des travaux, communications ;
* Rédiger les protocoles et être garant de leur évolution ;
* Rédiger les rapports scientifiques et technologiques pour les articles et demandes de financement.

Profil recherché

Connaissance, savoir :

* Connaissances approfondies des techniques de CRISPR /CAS9
* Maitrise des techniques de culture des cellules iPSC (regrogrammation, expansion
différentiation)
* Biologie moléculaire construction vecteurs, clonage, séquençage
* Savoir innover sur le plan technologique en accord avec sa hiérarchie pour développer les
innovations thérapeutiques


Savoir-faire :

Bases solides de d’ingénierie moléculaire et cellulaire pour réaliser :

* Culture et expansion des cellules souches pluripotentes dans les conditions de recherche et
de conditions GMP pour générer des futures matières premières pour applications cliniques
* Application et développement de nouvelles technologies d’édition du génome par utilisation
des outils de CRISPR/CAS au niveau des cellules iPSC
* Caractérisation des cellules iPSC (cytométrie de flux, tests moléculaires, tératomes)
* Développer des techniques de différenciation des cellules iPSC génétiquement modifiées macrophage, DC T, NK
* Animer et gérer les compétences au sein de l’équipe en partageant son savoir-faire et en formant les jeunes scientifiques

Diplômes : Doctorat en Science en biotechnologies, et immunologie

Savoir-être :

• Créativité et curiosité
• Capacités d'innovation
• Bonnes relations humaines ouvert au dialogue
• Autonomie
• Respectueux·se des règles de vie en communauté et confidentialité des travaux
• Bienveillance et sens du commun
• Capacité d'écoute, d'initiative, de travail en équipe


Information complémentaire :

Poste ouvert aux titulaires et/ou aux contractuels en CDD de 1 an