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L’équipe SyMMES/CREAB en collaboration avec deux équipes du CEA LETI et les équipes RDT et LERBO de l’IFREMER sont impliquées dans un nouveau projet ANR ALARMM pour la détection de microalgues dans l’eau de mer (programme PRC 2025, Axe H.11 – Capteurs, imageurs et instrumentation, CE42).
Les efflorescences d’algues toxiques sont des phénomènes sporadiques de plus en plus fréquentes qui représentent un risque sanitaire majeur et ont un impact économique significatif, notamment sur la conchyliculture et le tourisme. Leur détection précoce constitue un véritable défi, rendant indispensable une surveillance efficace du phytoplancton à l’aide de dispositifs performants sur le terrain.
Le projet ALARMM vise à développer un prototype innovant utilisable sur le terrain et reposant sur une méthode de détection et de quantification moléculaire de nouvelle génération : la digital droplet Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) en temps réel. Cette technologie permettra d’identifier et de quantifier avec précision certaines espèces d’algues toxiques faisant l’objet d’un suivi réglementaire.
L’équipe SyMMES/CREAB est plus particulièrement impliquée dans le développement des sondes ou amorces pour l’amplification de l’ADN génomique des microalgues. Le travail du ou de la personne recrutée sera axé sur le développement et l’ingénierie des séquences pour une détection multiplexe (plusieurs microalgues simultanément) et la mise en œuvre des protocoles biologiques (biologie moléculaire, biochimie) pour la détection d’ADN génomique à partir de l’amplification LAMP (une alternative isotherme de la PCR). Des expérimentations seront mises en place afin de démontrer les possibilités de quantification des cibles ADN avec un appareil commercial QuantStudio et les résultats seront comparés à ceux obtenus avec le prototype de terrain développé en parallèle au CEA LETI.
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