Assurer la responsabilité opérationnelle d'un cryo-microscope électronique à transmission (Glacios V2, 200 kV) en plateforme pour les caractérisations physico-chimique et structurale de différents types d'échantillons biologiques du laboratoire IMoPA.
Activités
- Réaliser ou superviser les images en microscopie électronique (coloration négative ou condition cryogénique) conduisant à la caractérisation ou la détermination de structures tertiaires des échantillons.
- Préparer des échantillons biologiques (cellules, nanoparticules, macro-complexes protéiques, particules ribonucléoprotéiques, ) en vue de leur analyse par microscopie électronique et cryo-microscopie électronique). L'ingénieur(e) aura également en charge la gestion de deux ultramicrotomes et d'un robot vitrificateur intégrés à la plateforme.
- Analyser des images en particule unique (SPA) pour des reconstitutions tridimensionnelles à hautes résolutions.
- Développer et optimiser les protocoles d'acquisition de données et de traitement d'image pour répondre aux besoins des projets de recherche du laboratoire en collaboration avec les chercheurs.
- Participer à l'interprétation des résultats scientifiques et à la rédaction de publications en collaboration avec les chercheurs.
- Former et encadrer les utilisateurs internes (y compris les étudiants) sur les aspects techniques et scientifiques de la ME.
- Maintenir et entretenir les équipements de la plateforme.
- Assurer la veille scientifique notamment en microscopie électronique.
- Réaliser le suivi qualité de la plateforme (label INFRA+).
- S'assurer du respect des règles d'hygiène et de sécurité.
- Travailler dans un laboratoire de préparation d'échantillons classé L2.
Compétences
- Savoirs : Le/la candidat(e) doit avoir de très bonnes connaissances en biochimie des acides nucléiques et des protéines, biophysique des interactions et biologie structurale intégrative.
- Savoir-faire : Une solide expérience des techniques de microscopie électronique classique et cryo-EM et une compétence en analyse de données via les logiciels de traitement d'images (RELION, CryoSPARC, ) seront indispensables. Une connaissance approfondie des techniques de préparation d'échantillons biologiques pour la microscopie électronique classique (inclusion en résine, coupe par ultramicrotomes) et cryo-EM (préparation d'échantillons vitrifiés) sera impérative. Des compétences en biologie moléculaire et cellulaire, et biochimie seront fortement recommandées.
- Savoir-être : Le/la candidat(e) doit être très motivé(e), capable de travailler dans une équipe multidisciplinaire, montrer une bonne communication orale et écrite en français et en anglais, rigoureux, avec un esprit d'analyse et autonome.
Contexte de travail
Le laboratoire IMoPA est une unité mixte de recherche entre le CNRS et l'Université de Lorraine (UMR 7365, voir http://www.imopa.cnrs.fr/ et https://www.univ-lorraine.fr/) située à Vandoeuvre-lès-Nancy. Il fait partie du pôle Biologie-Médecine-Santé (BMS, https://bms.univ-lorraine.fr). Le laboratoire est localisé sur le campus Biologie-Santé. Les thématiques de recherche abordées par les huit équipes (RNA/P, GlycoBio, EpiRedOx, S2BEAM, RempaCOAT, CImIND, CARPATH et ERCN) portent sur une variété d'expertises permettant de réaliser des études à l'échelon moléculaire, structural, cellulaire, ou intégré. Elles sont complétées par une recherche translationnelle pluridisciplinaire en thérapie cellulaire, médecine régénérative et dans le domaine des maladies inflammatoires chroniques et une recherche visant à la compréhension des mécanismes cérébraux sains et pathologiques de la cognition humaine.
Le candidat participera aux projets des différentes équipes du laboratoire IMoPA, qui offre un environnement de travail optimum avec un accès à de nombreux équipements de pointe pour la biologie structurale intégrée comprenant notamment un spectromètre RMN (Bruker) à 600 MHz avec une cryosonde TCI (1H, 13C et 15N), des robots de criblage (Mosquito and TECAN), un diffractomètre à rayons X (X8-Proteum Bruker), un cryo-microscope électronique à transmission de 200 kV (ThermoFisher Scientific, Glacios v2) et des appareils classiques de biophysique (ITC, DLS, CD, SPR). L'ensemble de ces équipements est regroupé au sein du Service Mutualisé de Plateformes (SMP) du pôle BMS et localisé au Biopôle, Campus Biologie-Santé à Vandoeuvre-lès-Nancy et à l'Institut Jean Lamour, Campus Artem à Nancy. Ils sont mis à disposition de la communauté scientifique via la plateforme B2S (https://umsibslor.univ-lorraine.fr/fr/plateforme/biophysique-biologie-structurale-b2s).
Le laboratoire IMoPA est une unité mixte de recherche entre le CNRS et l'Université de Lorraine (UMR 7365, voir http://www.imopa.cnrs.fr/ et https://www.univ-lorraine.fr/) située à Vandoeuvre-lès-Nancy. Il fait partie du pôle Biologie-Médecine-Santé (BMS, https://bms.univ-lorraine.fr). Le laboratoire est localisé sur le campus Biologie-Santé. Les thématiques de recherche abordées par les huit équipes (RNA/P, GlycoBio, EpiRedOx, S2BEAM, RempaCOAT, CImIND, CARPATH et ERCN) portent sur une variété d'expertises permettant de réaliser des études à l'échelon moléculaire, structural, cellulaire, ou intégré. Elles sont complétées par une recherche translationnelle pluridisciplinaire en thérapie cellulaire, médecine régénérative et dans le domaine des maladies inflammatoires chroniques et une recherche visant à la compréhension des mécanismes cérébraux sains et pathologiques de la cognition humaine.
Le candidat participera aux projets des différentes équipes du laboratoire IMoPA, qui offre un environnement de travail optimum avec un accès à de nombreux équipements de pointe pour la biologie structurale intégrée comprenant notamment un spectromètre RMN (Bruker) à 600 MHz avec une cryosonde TCI (1H, 13C et 15N), des robots de criblage (Mosquito and TECAN), un diffractomètre à rayons X (X8-Proteum Bruker), un cryo-microscope électronique à transmission de 200 kV (ThermoFisher Scientific, Glacios v2) et des appareils classiques de biophysique (ITC, DLS, CD, SPR). L'ensemble de ces équipements est regroupé au sein du Service Mutualisé de Plateformes (SMP) du pôle BMS et localisé au Biopôle, Campus Biologie-Santé à Vandoeuvre-lès-Nancy et à l'Institut Jean Lamour, Campus Artem à Nancy. Ils sont mis à disposition de la communauté scientifique via la plateforme B2S (https://umsibslor.univ-lorraine.fr/fr/plateforme/biophysique-biologie-structurale-b2s).
Contraintes et risques
Le poste est multisite. Le cryo-microscope Glacios 2 du SMP se trouve au sein de l'Institut Jean Lamour (IJL) à 10 min en voiture du Biopôle. Une fois par semaine, il est nécessaire de faire le plein en azote liquide du cryo-microscope à l'aide d'un tank sur roulettes de 200 litres. Le robot de vitrification se situe dans une salle L2 de l'IJL et les ultramicrotomes une autre salle qui sont proches du cryo-microscope. Des navettes Biopôle/IJL seront donc nécessaires plusieurs fois par semaine. Le/la candidat(e) devra adapter ses horaires aux contraintes liées à la responsabilité d'un équipement lourd en service commun (plateforme) et on heures d'ouverture de l'IJL.
Le poste est multisite. Le cryo-microscope Glacios 2 du SMP se trouve au sein de l'Institut Jean Lamour (IJL) à 10 min en voiture du Biopôle. Une fois par semaine, il est nécessaire de faire le plein en azote liquide du cryo-microscope à l'aide d'un tank sur roulettes de 200 litres. Le robot de vitrification se situe dans une salle L2 de l'IJL et les ultramicrotomes une autre salle qui sont proches du cryo-microscope. Des navettes Biopôle/IJL seront donc nécessaires plusieurs fois par semaine. Le/la candidat(e) devra adapter ses horaires aux contraintes liées à la responsabilité d'un équipement lourd en service commun (plateforme) et on heures d'ouverture de l'IJL.
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