Description de l'offre:Contexte et objectifs du stage :En 2015, une start-up française a découvert une microalgue, Amphidinium carterae, qui produit constitutivement la molécule amphidinol 18 (AM18) ayant une puissante activité anti-fongique contre des champignons phytopathogènes, responsables de maladie d?importance agronomique, tels que le mildiou de la vigne ou la fusariose du blé. Dans l?objectif de développer un produit de biocontrôle basé sur cette microalgue, il sera important d?obtenir des souches d?A. carterae montrant un gain d?activité anti-fongique.Au sein du laboratoire « Physiologie et Biotechnologie des Algues » d?Ifremer à Nantes, le stage cherchera à évaluer la faisabilité de la mutagenèse chez A. carterae en vue d?un gain d?activité anti-fongique.Pour cela, l?étudiant-e devra (i) adapter la méthodologie de mutagenèse aléatoire, déjà développée au laboratoire PBA sur d?autres espèces de microalgues, au dinoflagellé marin Amphidinium carterae et (ii) développer un système de criblage pertinent permettant de sélectionner les mutants d?intérêt.Méthodologie :L?établissement d?une méthode de sélection spécifique des mutants d?A. carterae montrant un gain d?activité anti-fongique est essentiel pour envisager le criblage à haut débit des souches produites par mutagenèse aléatoire. Cette action sera donc prioritaire et, dans le cadre du stage, plusieurs approches sont proposées : Etude de la littérature scientifique afin de recenser les différentes pistes possibles pour l?élaboration d?un tel crible.Des stratégies, d?ores et déjà identifiées comme pertinentes, seront évaluées expérimentalement. Celles-ci s?appuieront sur l?utilisation de biosenseurs de l?activité des amphidinols ou bien sur l?activité inhibitrice d?A. carterae sur l?activité photosynthétique d?une microalgue cible. Il s?agira donc de mettre au point ces cribles, en déterminant la sensibilité effective à l?AM18 et en recherchant les conditions qui en optimisent la réalisation.Enfin, en fonction de l?avancement, le stage pourra s?adresser à l?étude des conditions optimales de mutagenèse, en adaptant les protocoles mis au point au laboratoire aux spécificités d?A. carterae.Techniques employées :Cultures de microalgues ; cytométrie en flux ; microbiologie ; spectroscopie de fluorescence ; mutagenèse aléatoire Profil recherchéEtudiant H/F : Ingénieur ; Master 2 ; spécialité biotechnologie ; intérêt marqué pour les microalgues et leurs applications ; volonté de poursuivre son stage pour effectuer une thèse Cifre. Conditions de travail35h du lundi au vendredi
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