Laboratoire - Service
L’Unité U932 INSERM « Immunité et Cancer » située à l'Institut Curie est composée de 10 équipes regroupant environ 160 personnes, réparties sur deux bâtiments (Hôpital Curie et Bâtiment Constant-Burg, rue Lhomond). Les équipes de l’Unité tentent de mieux comprendre les réponses immunitaires, et d’apprendre au système immunitaire à mieux lutter contre les agents pathogènes et/ou les tumeurs. Les projets de recherche vont de l’immunologie fondamentale à l’immunothérapie translationnelle et à l’immunothérapie clinique chez des patients atteints de cancer.
Les équipes de recherche utilisent la microscopie optique à fluorescence pour visualiser différents processus biologiques dans des cellules (vivantes ou fixées), des tissus et des sphéroïdes constitués de cellules humaines ou de souris. Nous recherchons un ingénieur en analyse d’image (Bio-Image Analyst) enthousiaste et orienté service.
Le candidat travaillera dans l’Unité « Immunité et Cancer » et interagira étroitement avec le service d'imagerie cellulaire et tissulaire (PICT ; ). Il collaborera avec les chercheurs de l’unité et leurs collaborateurs, en les aidant à développer des solutions pour l'analyse des images. Les projets iront de la conception de flux d'analyse d'images, au développement de scripts/macros/plugins personnalisés, jusqu'à des collaborations plus complètes où l'analyste pourra prendre en charge une partie du projet et fournira les données analysées. Le candidat conseillera et enseignera également aux utilisateurs les stratégies d’analyse d’images. Il conseillera également les utilisateurs dans l’utilisation des microscopes pour une prise d’images de qualité et assurera la maintenance d’un microscope confocal présent dans l’unité.
Missions
Description des activités
· Superviser le fonctionnement et la maintenance des microscopes de l’Unité et former les utilisateurs pour assurer la qualité de la prise d’images
· Mettre en place, valider, maintenir et mettre à jour des outils d'analyse et de traitement d'images à partir d'ensembles de données de microscopie à fluorescence multidimensionnelle.
o Pour des questions récurrentes
o Pour des projets nécessitant des développements spécifiques
· Former les scientifiques à l'utilisation des outils développés et réaliser des tutoriels.
· Savoir utiliser et optimiser les réseaux en apprentissage profond (Deep-learning) ou se former à l’utilisation de ces outils.
· Réaliser une veille méthodologique (bibliographie) et implémenter au sein de l'équipe des pipelines existants pouvant être utiles
· Animer la communauté des scientifiques de l’unité faisant de la microscopie
· Participer à la rédaction des articles incluant de l’analyse d’images (matériel et méthodes, figures et légendes…)
· Savoir présenter ses résultats et méthodes en réunion d’équipe.
Pour ces tâches, l'ingénieur travaillera en collaboration avec les ingénieurs seniors du service d'imagerie cellulaire et tissulaire.
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