Topic description
Comprendre la distribution spatio-temporelle des agents pathogènes transmis par les tiques est essentiel pour évaluer le risque de maladie et mettre en œuvre des stratégies de prévention efficaces. En Europe, les maladies transmises par les tiques—en particulier la borréliose de Lyme, transmise par Ixodes ricinus—représentent un enjeu majeur de santé publique. Cependant, les déterminants écologiques de la distribution de ces agents pathogènes, dans l'espace et au cours du temps, restent encore insuffisamment compris, notamment dans les milieux non boisés tels que les jardins privés.
Cette thèse vise à étudier les facteurs écologiques et environnementaux expliquant les variations spatio-temporelles des agents pathogènes transmis par les tiques, à travers une approche multi-échelle combinant l'analyse de données de science participative à large échelle et des investigations écologiques à l'échelle locale.
(i) À l'échelle régionale, le ou la doctorant·e utilisera les données du programme CiTIQUE (–) pour analyser les variations spatio-temporelles de la diversité et de la prévalence des agents pathogènes dans deux régions françaises contrastées : le Grand Est (climat continental, avec des forêts allant de fragmentées à continues) et la Bretagne (climat océanique, forêts fragmentées). Le projet visera à évaluer l'influence de la structure du paysage et des caractéristiques des habitats — telles que la fragmentation, la connectivité et la composition de la végétation — ainsi que des variations temporelles, sur la présence des agents pathogènes dans les milieux boisés et les jardins privés. Une attention particulière sera portée aux différences entre agents pathogènes selon l'écologie de leurs hôtes (par exemple, associés aux rongeurs ou aux oiseaux).
(ii) À l'échelle locale, la thèse portera sur la circulation des agents pathogènes à l'interface rongeurs–tiques sur trois sites d'étude situés en forêt de Haye (près de Nancy). Le ou la doctorant·e analysera l'influence des caractéristiques des micro- et macro-habitats sur l'abondance des rongeurs et les taux de contact rongeurs–tiques, ainsi que l'effet des dynamiques temporelles des populations de rongeurs sur la transmission des agents pathogènes aux tiques.
Cette thèse permettra d'apporter une compréhension intégrée des mécanismes structurant la dynamique des agents pathogènes transmis par les tiques à différentes échelles spatiales et dans divers types d'habitats. Les résultats contribueront à améliorer les modèles d'évaluation du risque et à orienter les stratégies de prévention en santé publique.
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Understanding the spatio-temporal distribution of tick-borne pathogens is essential for assessing disease risk and implementing effective prevention strategies. In Europe, tick-borne diseases—particularly Lyme borreliosis, transmitted by Ixodes ricinus—represent a major public health concern. However, the ecological drivers shaping the spatial and temporal distribution of tick-borne pathogens remain insufficiently understood, especially in non-wooded environments such as private gardens.
This PhD project aims to investigate the ecological and environmental factors underlying the spatio-temporal variation of tick-borne pathogens, through a multi-scale approach combining large-scale citizen science data with local ecological investigations. The PhD project will be organized into two parts.
(i) At the regional scale, the PhD candidate will use data from the CiTIQUE program (–) to analyze the spatio-temporal variation in tick-borne pathogen diversity and prevalence across two contrasting French regions: Grand Est (continental climate, with forests ranging from fragmented to continuous) and Brittany (oceanic climate, predominantly fragmented forests). The project will investigate how landscape, habitat features—such as fragmentation, connectivity, and vegetation composition— as well as temporal variation shape pathogen occurrence and diversity in both wooded areas and private yards. Particular attention will be given to differences among pathogens according to the ecology of their hosts (e.g., rodent-associated versus bird-associated pathogens).
(ii) At the local scale, the PhD will focus on pathogen circulation at the rodent–tick interface across three study sites located in the Forêt de Haye (near Nancy). The PhD candidate will analyze how micro- and macro-habitat characteristics influence rodent abundance and rodent–tick contact rates, as well as how temporal fluctuations in rodent populations affect pathogen transmission to ticks.
This project will provide an integrated understanding of the mechanisms shaping the dynamics of tick-borne pathogens across spatial scales and habitat types. The findings will contribute to improving risk assessment models and informing public health prevention strategies.
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Début de la thèse : 01/11/
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Financement d'un établissement public Français
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