Le chercheur travaillera sur le projet européen APPEAL réunissant 13 partenaires de 6 pays, dont le CNRS - IRIM (équipe de Caroline Goujon). APPEAL (Antivirus Pandemic Preparedness EuropeAn pLatform) vise à améliorer la préparation aux futures pandémies en développant de nouveaux médicaments antiviraux à large spectre.
Dans ce cadre, le chercheur effectuera des cribles CRISPR en pool et au format HD-CA en lignées modèles et cellules primaires contre des virus respiratoires de classe 2 et de classe 3, ainsi que de la validation de ces gènes en épithélia respiratoires primaires cultivés à l'interface Air-Liquide (ALI) et la caractérisation fonctionnelle des gènes les plus intéressants.
Activités
- Culture cellulaire
- Clonage de banques CRISPR
- Cribles CRISPR en pool et HD-CA visant 2000 gènes humains sélectionnés pour leur capacité à réguler la réplication de virus de classe 2 et 3, en lignées cellulaires modèles et cellules primaires
- Validation des hits sur un panel de virus par des techniques classiques de virologie
- Production et manipulation de virus influenza A et SARS-CoV-2 en zône de confinement BSL2 et BSL3
- Génération d'épithélia respiratoires primaires à partir d'échantillons humains, génétiquement modifiés suivant les protocoles établis au laboratoire ou non
- Clonages moléculaires, immunoblots, etc
- Consigner les résultats obtenus dans un cahier de laboratoire, les analyser et les présenter sous forme de présentations scientifiques
- Caractérisation fonctionnelle des gènes identifiés
- Echanger très régulièrement avec les partenaires d’APPEAL, en particulier les virologistes et l’équipe développant les HD-CA, mais également avec l’ensemble des partenaires, participer aux réunions mensuelles du consortium en visio ainsi qu’aux réunions (bis-)annuelles en présentiel, rédiger des rapports d’activités
Compétences
- Connaissances de pointe en virologie et notamment sur les virus influenza et/ou SARS-CoV-2, expérience de manipulation de virus pathogènes en BSL2-3
- Expertise forte en biologie moléculaire et en virologie moléculaire
- Expertise en production du virus influenza de type A ou SARS2 par génétique inverse et connaissance des méthodes de titration (plaque assays) ou grande expérience en virologie moléculaire attestant de la capacité à apprendre rapidement
- Rigueur scientifique et intégrité
Contexte de travail
Le chercheur rejoindra l'équipe "interféron et restriction antivirale" dirigée par Caroline Goujon au sein de l’Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier (IRIM, UMR9004). L’institut est dédié à mieux comprendre les maladies infectieuses. L’équipe "interféron et restriction antivirale" étudie les mécanismes de défenses naturelles des cellules de mammifères contre les virus pathogènes humains, notamment respiratoires et en particulier les défenses induites par le système interféron. L’équipe développe également des projets de recherche fondamentaux et appliqués afin d’identifier de nouveaux inhibiteurs antiviraux, notamment dans le cadre du réseau européen APPEAL. L'IR sera amener à échanger avec ce réseau, à participer à des réunions mensuelles en visio et en présentiel (en Europe) 1 à 2 fois dans l'année.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Le chercheur rejoindra l'équipe "interféron et restriction antivirale" dirigée par Caroline Goujon au sein de l’Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier (IRIM, UMR9004). L’institut est dédié à mieux comprendre les maladies infectieuses. L’équipe "interféron et restriction antivirale" étudie les mécanismes de défenses naturelles des cellules de mammifères contre les virus pathogènes humains, notamment respiratoires et en particulier les défenses induites par le système interféron. L’équipe développe également des projets de recherche fondamentaux et appliqués afin d’identifier de nouveaux inhibiteurs antiviraux, notamment dans le cadre du réseau européen APPEAL. L'IR sera amener à échanger avec ce réseau, à participer à des réunions mensuelles en visio et en présentiel (en Europe) 1 à 2 fois dans l'année.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques
Travail en laboratoires de confinement BSL2 et BSL3
Travail en laboratoires de confinement BSL2 et BSL3
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