Description
of the project
Objectifs du stage : L'objectif du stage est de caractériser quantitativement la liaison des protéines MFT/SMFT à des interfaces lipidiques modèles mimant les LDs des plantes, et de déterminer comment des paramètres physiques tels que la tension interfaciale, la composition lipidique et la température influencent cette liaison.
Le/la stagiaire sera amené(e) à :
- Produire des gouttelettes lipidiques monodisperses par membrane emulsification et/ou des liposomes géants (GUVs) via électroformation ou méthodes à co-solvant.
- Fonctionnaliser ces interfaces modèles avec des phospholipides pertinents pour les LDs de plantes et avec des protéines MFT/SMFT fluorescentes (en collaboration avec l'équipe de biologie végétale).
- Mettre en œuvre une microscopie de fluorescence quantitative pour mesurer des isothermes d'adsorption et en déduire des constantes d'affinité interfaciale.
- Comparer différents régimes mécaniques : membranes de GUVs faiblement tendues et fluctuantes thermiquement d'une part, interfaces de gouttelettes à tension contrôlée d'autre part.
- Explorer comment ces contraintes mécaniques contrôlent l'accumulation, la distribution spatiale et l'organisation collective des protéines à l'interface.
- Ce travail permettra d'établir un cadre quantitatif pour décrire les interactions protéine–lipide au niveau des gouttelettes lipidiques de plantes, un sujet encore très peu exploré.
Dimension interdisciplinaire et perspectives. Le projet se situe à l'interface de la biologie végétale, de la physique de la matière molle, de la microfluidique et de l'imagerie quantitative. L'équipe de Victoria Gomez (IBPS) apporte son expertise en génétique d'Arabidopsis, expression et caractérisation de protéines de la famille PEBP. L'équipe de Jacques Fattaccioli (CPCV/IPGG) apporte des approches avancées de microfluidique, de biophysique interfaciale et d'analyse quantitative d'images.
3. Techniques ou méthodes utilisées / Specific techniques or methods
Le/la stagiaire sera formé(e) à :
(i) la préparation et la manipulation de systèmes modèles d'interfaces lipidiques (émulsions, GUVs), (ii) la microscopie de fluorescence et l'analyse quantitative d'images (ImageJ, Python),
(iii) des concepts de biophysique interfaciale et de matière molle, etc.
4. Références / References
1. Kretzschmar, FK., Doner, NM., Krawczyk, HE., Scholz, P., Schmitt, K., Valerius, O., Braus, GH., Mullen, RT., Ischebeck, T.. Identification of Low-Abundance Lipid Droplet Proteins in Seeds and Seedlings. Plant Physiol. :-. doi: 10./pp.19..
2. Pinon, L., Montel, L., Mesdjian, O., Bernard, M., Michel, A., Ménager, C., and Fattaccioli, J.. Kinetically Enhanced Fabrication of Homogeneous Biomimetic and Functional Emulsion Droplets. Langmuir 34, –.
Encadrement et lieu
Le stage se déroulera principalement à l’Institut Pierre-Gilles de Gennes et à l’IBPS, à Paris (France).
Encadrement par Jacques Fattaccioli (CPCV, SU, ENS-PSL) et Victoria GOMEZ (IBPS, SU).
Profile
- Étudiant(e) de Master 2 en physique, chimie, physico-chimie, sciences des matériaux ou disciplines voisines.
- Intérêt pour les problématiques à l’interface de la physico-chimie avec la biologie des plantes
- Compétences appréciées :formulation, microscopie, traitement de données.
- Autonomie, rigueur et goût pour le travail en équipe.
Starting date
-02-02
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