H/f post-doc cdd génétique et génomique quantitative dans une contexte d'aptation au milieu urbain

Vos missions en quelques mots Missions : Les villes sont un cadre privilégié pour étudier les réponses des organismes aux changements environnementaux d’origine humaine. L’urbanisation est souvent associée à des phénotypes particuliers comme une plus petite taille ou une reproduction plus précoce chez les oiseaux. Ces traits peuvent résulter de réponses plastiques ou d’une évolution rapide face à de fortes pressions sélectives, notamment des températures plus élevées. Il est donc essentiel d’évaluer la part de ces mécanismes afin de savoir si les organismes urbains pourraient être préadaptés au changement climatique. Dans le cadre de l'axe 2 de l'ANR ACACIA (Adapting to Cities And Climate change In interAction), la personne engagée sur ce post-doctorat de un an aura pour objectifs 1. de comparer le potentiel évolutif des oiseaux urbains et forestiers en conduisant des analyses de génétique quantitative sur un jeu de données combinant mesures morphologiques et de traits de reproducion et matrices d'apparentement entre les individus 2. d'explorer la génomique de l'adaptation au milieu urbain en utilisant un jeu de données d'un millier d'individus séquencés en RADseq, et issus à la fois de captures en milieu naturel, mais aussi de deux expériences de jardin commun menées en 2022 et 2024. Activités : - Analyses de données à l’aide de modèles de génétique quantitative - Analyses en génomique de l’adaptation (données de séquençage déjà disponibles) - Contribution à la collecte de données sur le terrain durant le suivi de reproduction des mésanges au printemps - Écriture d’articles - Participation à la vie de l’équipe E3CO et du département EEC - Présentation des travaux à des évènements scientifiques et/ou grand public Contexte de travail : Le travail se fera au CEFE (Centre d'Écologie Fonctionnelle et Évolutive, UMR 5175, Montpellier), dans l’équipe E3CO (Écologie Évolutive Empirique, Communication & Coopération), au sein du projet ACACIA (ANR projet ANR-22-CE02-0004-01, 2023-2028) porté par Anne Charmantier. Pour les analyses de génétique quantitative, le.la candidat.e sera en interaction avec Céline Teplitsky (CEFE) et des collaborateurs internationaux qui se réunissent une fois par mois (Drew Sauve, Timothée Bonnet, Pierre de Villemereuil). Pour les analyses en génomique, une collaboration est déjà en cours avec Charles Perrier du CBGP et Laura Gervais du CEFS. Le travail de terrain se fera en collaboration avec les agents du CEFE de la plateforme PLT (Programmes à Long Termes) ainsi que les étudiants, chercheurs et IT de l’équipe. Profil recherché Competences : - Expertise en écologie évolutive - Maîtrise avancée des outils de génétique quantitative et/ou de génomique - Expérience de terrain, en particulier pour la capture et le baguage de passereaux - Indépendance, capacités organisationnelles et de communication - Expérience en rédaction et soumission d’articles scientifiques dans le domaine de l’écologie evolutive Contraintes et risques : Le travail de terrain est planifié en fonction de la phénologie des oiseaux et des possibilités de capture. Il peut donc avoir lieu tôt dans la journée ainsi que pendant les week-ends. Le travail de terrain implique des déplacements en voiture sur les sites d’étude, l’utilisation d’échelles et la manipulation d’oiseaux sauvages. Des formations sont proposées pour préparer l’agent à chaque aspect du travail de terrain. Les analyses de données ne représentent aucun risque. Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français Seuil