Overview
Présentation INRAE
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi‑performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
Vous serez accueilli(e) au sein de L’UMR Santé de la Vigne et Qualité du Vin (SVQV), équipe Virologie et Vection dans le cadre d’un stage de fin d’études.
Environment, missions and activities
Les virus constituent une menace majeure pour la végétation naturelle ainsi que pour les plantes cultivées. Le Grapevine fanleaf virus (GFLV, Nepovirus, Secoviridae) transmis par le nématode Xiphinema index, est considéré comme l’un des virus les plus dommageables de la vigne. Il est présent dans la plupart des vignobles du monde et affecte environ deux tiers des parcelles cultivées en France, avec des pertes de rendement importantes et des coûts économiques élevés. Le contrôle repose principalement sur des mesures prophylactiques et le déploiement de variétés résistantes, dont les gènes antiviraux identifiés restent limités et peuvent être contournés.
La prémunition (ou protection croisée) représente une alternative prometteuse. Cette méthode consiste à infecter une plante avec un virus peu agressif pour la protéger contre une infection ultérieure par un virus apparenté plus agressif. Le RNA silencing pourrait être impliqué dans ce processus. Le stage vise à évaluer l’implication du RNA silencing dans la prémunition vis‑à‑vis du GFLV chez Arabidopsis thaliana. Des tests sur témoins sauvages et sur des lignées mutantes déficientes pour certains composants de la machinerie du siRNA seront effectués. Si le temps le permet, un séquençage Illumina des petits ARN pourra être réalisé pour comparer les profils.
Activités
* Préparer les inocula viraux et inoculer mécaniquement les plantes.
* Réaliser l’échantillonnage des feuilles à différents temps post‑inoculation.
* Extraire et doser les ARN totaux.
* Effectuer les RT‑qPCR pour quantifier la charge virale des variants primo‑infectant et challenger.
* Analyser les données qPCR et réaliser les statistiques associées.
* (Optionnel) Préparer les échantillons pour séquençage Illumina des petits ARN.
Conditions particulières d’activité
Travail en laboratoire confinée de type L2.
Formation et compétences recherchées
Licence (Bac+3)
* Formation recommandée : Master 2 ou ingénieur(e) en 3e année dans le domaine de la biologie végétale, biologie moléculaire, microbiologie, virologie, agronomie, biotechnologie ou discipline équivalente. Connaissances en interactions plante‑microorganismes, intérêt pour la virologie végétale. Compétences en extraction d’ARN, qPCR et analyses statistiques (R). Capacités rédactionnelles.
* Expérience appréciée : Biologie moléculaire (extraction d’ARN, qPCR) et analyses statistiques. Aptitude au travail en équipe et à la communication scientifique.
Envoyer lettre de motivation et CV à Anne.Sicard@inrae.fr et sulyvann.chereau@inrae.fr avec pour objet « Stage_prémunition_Nom_Prenom » avant le 31/10/2025
Votre qualité de vie à INRAE
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) : jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein), soutien à la parentalité, dispositifs de développement des compétences, accompagnement social, prestations vacances et loisirs, activités sportives et culturelles, et restauration collective.
Modalités pour postuler
J’envoie mon CV et ma lettre de motivation.
Les personnes accueillies à INRAE doivent respecter les dispositions du Code de la fonction publique, notamment en matière de neutralité et de laïcité. En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr
Informations complémentaires
* Seniority level: Internship
* Employment type: Full-time
* Job function: Education and Training
* Industries: Research Services
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