Le poste sera localisé à l'UMR EcoFoG à Kourou en Guyane. EcoFoG est une unité qui développe des recherches en écologie tropicale allant de la caractérisation de la diversité jusqu'à la valorisation des ressources. La personne recrutée intégrera l'axe Evolution, Ecologie Chimique et Moléculaire dont l'objectif est l'étude de ces processus qui modulent la diversité moléculaire, chimique et des traits, tous participant à la performance des individus dans leur environnement.
Les enjeux du poste portent sur la production de données génétiques de haute qualité, leur structuration et leur exploitation, afin de mieux comprendre les mécanismes d'évolution et d'adaptation des espèces tropicales dans des environnements complexes et changeants.
Vous participerez à la mise en oeuvre des projets scientifiques du laboratoire, depuis la production de données biologiques jusqu'à leur analyse et leur valorisation. Vous interviendrez à toutes les étapes de la chaîne de production des données notamment génétiques : installation et suivi des dispositifs expérimentaux sur le terrain, collecte et mesures des fonctions écosystémiques, analyses en laboratoire.
Activités principales
Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :
Biologie moléculaire et production de données
- Réaliser les extractions d'ADN et d'ARN à partir de matrices variées (tissus, sols.)
- Effectuer les amplifications PCR et préparer les librairies pour le séquençage haut débit
- Adapter les protocoles expérimentaux aux contraintes des échantillons
Gestion et valorisation des données génomiques
- Assurer la réception, la structuration et la bancarisation des données de séquençage
- Participer aux analyses bioinformatiques de premier niveau (filtres, bases de références)
- Contribuer à la traçabilité des données et métadonnées associées aux projets
Fonctionnement du laboratoire et appui aux activités scientifiques
- Gérer les stocks, commandes et le suivi des consommables et réactifs
- Tenir à jour les cahiers de laboratoire et participer à la gestion quotidienne du laboratoire
- Participer à la préparation et au suivi des missions de terrain en milieu tropical
- Contribuer à la formation technique des stagiaires et utilisateurs
Compétences attendues :
Une formation en biologie moléculaire, génétique, génomique ou sciences du vivant est recommandée. Une expérience en biologie moléculaire est attendue, et une première pratique de la bioinformatique est un atout.
Savoir-faire :
Mettre en oeuvre des protocoles de biologie moléculaire (extraction, PCR, séquençage)
Adapter des protocoles à différents types d'échantillons biologiques
Gérer et structurer des données génétiques et métadonnées associées
Utiliser des outils de base en bioinformatique et en gestion de données
Savoir-être :
Rigueur et sens de l'organisation dans le traitement des échantillons et données
Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire
Autonomie et adaptabilité, notamment en contexte de terrain tropical
Curiosité scientifique et sens de l'initiative
Capacité à interagir avec différents interlocuteurs et à rendre compte de son activité
Contraintes et risques
- Missions sur le terrain en milieu tropicale
- Manipulation de produits chimiques
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