Mission :
La mission principale de l'assistant ingénieur (H/F) se fera dans le cadre du Projet de Recherche Translationnelle en Cancérologie portant sur les cancers du sein ER+/ HER2– avec mutation BRCA ou altération de la recombinaison homologue et présentant une double dépendance à la signalisation hormonale et à la réparation de l'ADN. L'assistant ingénieur (H/F) sera détaché sur la plateforme d'histopathologie expérimentale de l'IPC/CRCM (ICEP). Il / elle aura pour mission de caractériser, par imagerie multiplex MACSima, les profils protéiques spatiaux des altérations de la réponse aux dommages de l'ADN et immuno- oncologiques au sein de cohortes de bons et mauvais répondeurs de l'essai DOLAF qui a montré une hétérogénéité marquée de réponses aux traitements.
Activités :
• Mise au point des marqueurs de la réponse aux dommages de l'ADN (DDR) par immunohistochimie/immunofluorescence dans les conditions expérimentales du MACSima Miltenyi.
• Transfert des protocoles au MACSima Miltenyi.
• Conception des panels associant des cibles immuno-oncologie validées et les protéines DDR.
• Preprocessing des données brutes issues du MACSima et contrôle qualité.
L'assistant ingénieur-e aura :
• Une forte expertise technique en IHC et IHC multiplex dans le visible et/ou en fluorescence : mises au point et conduite de projets/protocoles
• La connaissance technique des outils de microscopie, des scanners de lames et des automates d'IHC
• La maitrise des techniques classiques utilisées en histologie : connaissance de l'échantillon en FFPE, coupes, colorations, Immunohistochimies, TMA..
• La connaissance du logiciel MACSiQ serait un plus
• Une expertise en transcriptomique spatiale serait un plus (technologies Visium et Xenium 10X Genomics)
L'assistant ingénieur (H/F) contribuera à la valorisation scientifique des données :
• Participer à la rédaction de protocoles et de rapports d'activité
• Contribuer à la préparation de publications scientifiques et communications
• Présenter les avancées techniques en réunion de plateforme et d'équipe
• Gérer les stocks des consommables nécessaires aux expérimentations
• Assurer la maintenance des équipements dédiés
• Participer aux actions de structuration et amélioration continue de la plateforme ICEP
• Participer à la formation des utilisateurs de la plateforme ICEP
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