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Présentation INRAE
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
Vous serez accueilli(e) au sein de L’Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), au sein de l’équipe Écologie et Génétique des interactions Plantes–Microbiotes–Bioagresseurs (PMB), sur le centre INRAE Bretagne-Normandie à Le Rheu (Rennes Métropole). Cette équipe est spécialisée en écologie microbienne et travaille sur la compréhension des interactions plante-microbiote et insecte-microbiote. Vous serez recruté(e) sur le projet EXPLORAE TARGET (Vers la culture et l’ingénierie génomique de bactéries pathogènes non-cultivées). Le projet TARGET développe une stratégie résolument transdisciplinaire, articulant microbiologie expérimentale, modélisation de réseaux métaboliques à l’échelle système et analyses multi-omiques pour lever le verrou de la culture de phytoplasmes. Le WP3 joue un rôle central dans cette intégration en traduisant les prédictions issues des modèles métaboliques en protocoles expérimentaux testables, puis en réinjectant les résultats expérimentaux dans une boucle d’optimisation. Le poste s’adresse à un·e ingénieur·e de recherche souhaitant évoluer à l’interface entre expérimentation et modélisation, dans un environnement scientifique favorisant les échanges méthodologiques et la co-construction interdisciplinaire.
Environnement de travail, missions et activités
Vous serez plus particulièrement en charge de :
-Mettre en œuvre et optimiser des approches de microbiologie expérimentale pour cultiver et étudier les Mollicutes et phytoplasmes.
-Définir, tester et optimiser des conditions de culture (milieux et nutriments, température, pression en oxygène…) à l’aide d’outils de phénotypage haut-débit et de dispositifs de contrôle gazeux.
-Développer et exploiter des méthodes de suivi de la croissance bactérienne, incluant des approches ciblant des activités métaboliques ou physiologiques.
-Traduire des prédictions issues de la modélisation de réseaux métaboliques en protocoles expérimentaux afin d’affiner de manière itérative la formulation de milieux définis ou quasi- définis, en lien étroit avec les équipes de modélisation du projet.
-Produire et tester des milieux de cultures à base d’extraits de plante, d’insecte ou de cultures microbiennes.
-Participer à la valorisation scientifique des résultats, notamment par la rédaction de publications et de communications scientifiques.
-Contribuer à la capitalisation, à la traçabilité et à la pérennisation des protocoles, méthodes et jeux de données développés dans le cadre du WP3 du projet.
Travail en laboratoire de microbiologie à accès réglementé.
Des déplacements professionnels réguliers sont à prévoir au sein de l'équipe Mollicutes de l'unité BFP (Biologie du Fruit et Pathologie), centre INRAE de Villenave-d'Ornon (Bordeaux), partenaire et coordinateur du projet..
Formations et compétences recherchées
Doctorat/Ingénieur grandes écoles
* Formation recommandée : Diplôme d’ingénieur ou doctorat en microbiologie, biologie des systèmes, bioingénierie ou discipline apparentée.
* Connaissances souhaitées : Microbiologie expérimentale. Physiologie bactérienne et biochimie. Intérêt pour les systèmes expérimentaux complexes et la miniaturisation.
* Expérience appréciée : Expérience dans un contexte de recherche interdisciplinaire. Pratique ou intérêt pour des approches à haut débit et les plans d'expériences complexe. Pratique ou intérêt pour les statistiques appliquées à la microbiologie.
* Aptitudes recherchées : Capacité à travailler dans un environnement collaboratif et interdisciplinaire. Rigueur scientifique, autonomie méthodologique et sens de l’organisation. Intérêt pour la production scientifique collective et l’appui méthodologique à des projets de recherche.
Votre qualité de vie à INRAE
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :
- jusqu'à30 jours de congés+ 15 RTTpar an (pour un temps plein)
- d'un soutienà la parentalité : CESUgarded'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences: formation, conseilen orientation professionnelle ;
- d'un accompagnementsocial : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestationsvacancesetloisirs :chèque-vacances,hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activitéssportivesetculturelles ;
- d'unerestaurationcollective.
Modalités pour postuler
J'envoie mon CV et ma lettre de motivation
Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr
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