Le Centre de Ressources Biologiques de l'Institut Pasteur (CRBIP) est une infrastructure de biobanque, avec une fonction transversale, qui regroupe des collections de spécimens microbiens et humains de l'Institut Pasteur. Ses missions sont de préserver et fournir à l'échelle mondiale des bio ressources microbiennes et humaines provenant des collections historiques ou récentes, à des fins de recherche, formation et contrôle qualité.
Le CRBIP reçoit, préserve, caractérise et distribue des ressources biologiques en France et à l'international, en conformité avec les standards de sécurité et les lois et règlementations en vigueur.
Un Project Management Office (PMO) du CRBIP récemment formalisé gère les projets transversaux - autres que les projets de recherche interne - liés à la valorisation, la qualité et l'optimisation.
Le spécialiste en taxonomie génomique et services bioinformatiques, sous la direction opérationnelle du chef du groupe GIPhy, applique les connaissances scientifiques spécifiques au domaine dans les technologies à haut débit (HTS) et les techniques spécialisées de traitement des données pour valider et mettre en œuvre des stratégies bioinformatiques existantes et nouvelles en génomique microbienne et en taxonomie génomique. Le spécialiste collabore avec d'autres scientifiques du CRBIP pour mettre en œuvre et fournir des solutions et des services innovants.
Principales responsabilités
- Appliquer les outils de taxonomie génomique, en fournissant une caractérisation et des interprétations de haute qualité des données génomiques microbiennes.
- Appliquer les flux de travail dans le contexte du contrôle de la qualité des données de séquence du génome entier (WGS) des souches microbiennes.
- effectuer des analyses taxonomiques génomiques de routine et préparer les rapports correspondants avec des fonctionnalités de visualisation des données
- évaluer et interpréter des données HTS complètes provenant de génomes microbiens entiers afin de contribuer à l'attribution d'une taxonomie précise, à la génomique comparative et à la production de matériel de référence
- appliquer des outils et des stratégies pour les analyses génomiques fonctionnelles, permettant l'identification du codage génétique potentiel pour des classes de composés spécifiques, afin de traduire les données génomiques en idées.
- travailler conformément aux normes d'accréditation internationales, en garantissant une traçabilité et une documentation complètes des pipelines, des bases de données de référence, des données brutes et des rapports
- Déposer des données génomiques dans des dépôts publics internationaux.
- développer et appliquer des procédures d'intégration et de conservation des données
- participer à la préparation de graphiques, de tableaux et de figures pour la documentation de la validation des logiciels et les présentations
- Participer aux projets de recherche internes et collaboratifs du CRBIP.
Diplômé d'un bac+5 en bio-informatique et/ou bio-statistiques, vous avez une première expérience professionnelle dans un poste similaire.
Savoir-faire :
- Maîtrise en bio informatique, spécifiquement appliquée à la génomique microbienne.
- Expérience avérée dans le traitement des données HTS
- Expérience démontrée dans l'utilisation courante d'outils bio informatiques liés à l'analyse WGS.
Apprécié :
- maîtrise des référentiels de données génomiques nationaux et internationaux
- Maîtrise des scripts Shell Linux (Bash)
Vos conditions et environnement de travail :
- Politique de congés et RTT très favorable (Forfait 204 jours)
- Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport
- Possibilité de télétravail
- Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias
- Mutuelle et service de santé pour les collaborateurs
- Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives
- Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées
- Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités).
Profil:
Diplômé d'un bac+5 en bio-informatique et/ou bio-statistiques, vous avez une première expérience professionnelle dans un poste similaire.
Savoir-faire :
- Maîtrise en bio informatique, spécifiquement appliquée à la génomique microbienne.
- Expérience avérée dans le traitement des données HTS
- Expérience démontrée dans l'utilisation courante d'outils bio informatiques liés à l'analyse WGS.
Apprécié :
- maîtrise des référentiels de données génomiques nationaux et internationaux
- Maîtrise des scripts Shell Linux (Bash)
Vos conditions et environnement de travail :
- Politique de congés et RTT très favorable (Forfait 204 jours)
- Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport
- Possibilité de télétravail
- Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias
- Mutuelle et service de santé pour les collaborateurs
- Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives
- Engagements RSE forts, et initiatives des collaborateurs encouragées
- Environnement multiculturel (plus de 75 nationalités).
Informations supplémentaires:
Certification ou habilitation requise: Aucune
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