Ingénieur de recherche h/f

MétierRecherche clinique - Autres métiersType de contratCDD uniquementService d'affectationInformatique biomédicalePrésentation du service
Le service d'information biomédicale est constitué de trois unités fonctionnelles : l'UF de Santé numérique, l'UF de Biostatistique et l'UF d'informatique translationnelle. Le service assure un ensemble de mission centrée autour des données hospitalières, de l'usage et l'évaluation des systèmes d'information, de l'aide à la décision et de l'intelligence artificielle en santé.

Le service est composé de deux PU-HP, une PH, deux MCU-PH, un PHU, un CCA, de trois ingénieurs permanents, d'une data-scientiste et de 4 ingénieurs sur projets.

Liaisons hiérarchiques directes(N+1) : Ivan Lerner (responsable scientifique)

Liaisons fonctionnelles: Louis Boutin (responsable médicale)
Vos missions
Le poste s'inscrit principalement dans le projet RAISE-AKI, visant à développer des modèles de prédiction du risque d'insuffisance rénale aiguë postopératoire à partir de données cliniques hospitalières, et dans le développement de la librairie aircohort, dédiée à la structuration reproductible des données issues des entrepôts de données de santé.

L'ingénieur de recherche interviendra comme exécutant technique principal sur le projet RAISE-AKI, sur les aspects data science et modélisation. Il sera accompagné d'étudiants en master 2 de formation initiale médicale.

Les missions incluent notamment :

préparation, nettoyage et structuration de données cliniques issues de l'entrepôt de données de santé de l'HEGP ;

conception et implémentation de features cliniques pertinentes (feature engineering) à partir de données structurées ;

développement, entraînement et évaluation de modèles de machine learning existants pour la prédiction du risque d'insuffisance rénale aiguë postopératoire ;

calibration des modèles et analyse de leurs performances ;

interprétation des modèles (notamment via des méthodes de type SHAP) ;

participation à la production des résultats scientifiques du projet (analyses, figures, tableaux)

Les développements seront réalisés principalement en Python, en s'appuyant sur scikit-learn et les outils standards de la science des données.

L'ingénieur de recherche sera contributeur principal au développement de la librairie aircohort, avec un rôle structurant sur les aspects techniques.

Les missions incluent :

contribution au développement de pipelines réutilisables d'extraction et de structuration de données de santé (SQL Python) ;

mise en oeuvre des principes de reproductibilité, traçabilité et mutualisation des traitements de données ;

articulation étroite entre les besoins du projet RAISE-AKI et le développement générique de la librairie (RAISE-AKI servant d'étude pilote pour aircohort) ;

collaboration avec les autres data scientists et chercheurs impliqués dans la librairie.

Organisation de travail :

- Durée : 6 à 7 mois
- Télétravail : 2 jours par semaines

Merci d'envoyer vos candidatures à : @.**

Profil recherché
Formation et expérience
Doctorat (thèse) en machine learning, data science, statistiques, informatique
Une expérience préalable sur des données de santé ou hospitalières est souhaitable, mais non indispensable.

Compétences techniques
Bonne maîtrise de Python pour la data science.
Bonne maîtrise de SQL.
Connaissances solides en machine learning (modèles tabulaires, évaluation, calibration).
Expérience avec scikit-learn.
Intérêt pour les problématiques de reproductibilité et de structuration des données.

Qualités personnelles
Autonomie dans le travail.
Rigueur scientifique et méthodologique.
Capacité à travailler en interaction avec des cliniciens et des chercheurs.
Schéma horaireJourTemps de travail7h30Horaires de travailHoraires : 9h-18hTélétravailOuiVos avantages à l'AP-HP
· Valorisation financière (primes diverses, intégration des mesures du Ségur de la Santé)

· Places en crèche disponibles

· Self, possibilité de place de parking, politique sociale attractive (tarifs avantageux sur les loisirs, vacances)

· Remboursement à 75% du titre de transport

· Plateforme «Hoptisoins»: tarifs préférentiels chez nos partenaires (vie quotidienne, courses)

· Espace de détente dédié au personnel «Bulle»: activités sportives et culturelles gratuites variées (yoga, pilâtes, boxe), salle de repos en libre accès

· Possibilité d'évolution, de promotion professionnelle et de formation au sein du GHU

Description de l'hôpitalRejoignez le groupe hospitalo-universitaire AP-HP. Centre - Université Paris Cité.
Particulièrement bien desservi par les transports, il couvre le centre-ouest de Paris et regroupe des hôpitaux emblématiques que sont l'hôpital Cochin - Port Royal, l'hôpital Necker-Enfants malades, l'hôpital européen Georges-Pompidou et l'Hôtel-Dieu.
Il comprend également des hôpitaux largement reconnus sur les spécialités gériatriques, de réadaptation ou de psychiatrie, les hôpitaux Broca-La Collégiale, Corentin-Celton et Vaugirard-Gabriel-Pallez.
Le GHU abrite par ailleurs le siège du SAMU de Paris.
Nos hôpitaux offrent ainsi à tous les âges de la vie des prises en charge adaptée à toutes les pathologies, des plus simples aux plus complexes et abritent 99 centres de référence maladies rares.
Chaque année, nos 18 000 professionnels prennent en charge plus de 1 800 000 patients.
Rattachées à l'Université Paris Cité, les équipes proposent également une prise en charge de haut-niveau à la pointe de l'innovation grâce à une très forte synergie entre les unités cliniques, les unités de recherche et nos plateaux techniques de pointe et un très fort engagement dans la la recherche clinique dans laquelle notre groupe hospitalo-universitaire est un acteur majeur.
La dimension universitaire se traduit également par l'accueil de 1600 internes et étudiants hospitaliers et plus de 3200 étudiants paramédicaux chaque année.
Rejoignez-nous, nous vous attendons !Référence de l'offre2