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Ingénieur de recherche bioinformaticien - projet erc genemotors f/h

Paris
Institut Curie
Ingénieur de recherche
Publiée le 24 mars
Description de l'offre

Le laboratoire La personne recrutée rejoindra l'équipe dirigée par Leonid Mirny à l'Institut Curie, affiliée à la fois à l'Institut Curie (Paris) ? UMR3664 et au Massachusetts Institute of Technology (MIT). L'équipe étudie les principes physiques de l'organisation du génome et leur impact sur la fonction cellulaire, en combinant modélisation théorique, approches computationnelles et interactions étroites avec des collaborateurs expérimentaux. Une part importante de nos recherches actuelles porte sur la compréhension des mécanismes par lesquels l'extrusion de boucles médiée par la cohésine et le repliement de la chromatine régulent la communication entre enhancers et promoteurs. Le projet Ce poste s'inscrit dans le cadre d'un projet financé par une subvention ERC, visant à comprendre les principes mécanistiques par la cohésine contrôle la régulation génique à longue distance. La question centrale du projet ERC GeneMotors est la suivante : Comment l'extrusion de boucles d'ADN par la cohésine permet-elle la communication entre enhancers et promoteurs sur de grandes distances génomiques, et comment des paramètres de contrôle tels que le positionnement de CTCF, la processivité ou la directionnalité du moteur influencent-ils l'activité transcriptionnelle ? Le projet vise à développer un cadre prédictif et quantitatif reliant : - Les propriétés moléculaires de la cohésine (vitesse, processivité, directionnalité, capacité de franchissement d'obstacles) - Le repliement de la chromatine en boucles et en domaines topologiques (TADs) - La probabilité et la stabilité des contacts enhancer?promoteur - L'activité transcriptionnelle résultante Missions - Développer et étendre des modèles mécanistiques de communication enhancer?promoteur pilotés par l'extrusion de boucles - Mettre en oeuvre et analyser des modèles stochastiques 1D à grande échelle ainsi que des simulations polymériques 3D de l'organisation de la chromatine - Analyser quantitativement des données génomiques, transcriptionnelles et d'imagerie afin de confronter les prédictions théoriques aux observations expérimentales - Travailler en interaction étroite avec des collaborateurs expérimentaux afin d'affiner itérativement les modèles - Contribuer aux publications scientifiques et aux présentations dans le cadre d'un consortium international Formation et compétences - Doctorat en physique théorique, biophysique ou mathématiques appliquées - Maîtrise de l'anglais indispensable (langue de travail de l'équipe) Aptitudes requises - Solides compétences en programmation (Python requis) et expérience en calcul scientifique et simulations numériques - Formation approfondie en modélisation de physique statistique, notamment en physique des polymères appliquée à la chromatine et en modèles 1D fortement corrélés - Expérience dans l'analyse quantitative de données biologiques (génomique, transcription ou imagerie) - Connaissances approfondies en biologie de la chromatine et régulation génique - Capacité à travailler de manière autonome tout en s'intégrant dans un environnement interdisciplinaire et collaboratif - Aptitude à articuler modélisation théorique et données expérimentales dans une démarche itérative fondée sur des hypothèses mécanistiques Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap. Informations sur le contrat Type de contrat : COD Date de démarrage : dès que possible Durée du contrat : 18 mois, renouvelable Temps de travail : Temps complet Rémunération : selon les grilles en vigueur Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d'entreprise Localisation du poste : Paris Contact Pour postuler, merci d'envoyer CV et lettre de motivation Date de parution de l'offre : 19/03/2026 Date limite des candidatures : jusqu'à ce que le poste soit pourvu. L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances. Il s'engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche. https://euraxess.ec.europa.eu/sites/default/files/brochures/eur_21620_en-fr.pdf L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale. L'objectif du Centre de recherche de l'institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d'utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l'innovation au service du malade.

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