Ingénieur-e en bio-imagerie computationnelle h/f

Informations générales

Réservé uniquement aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI)
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e en bio-imagerie computationnelle H/F
Référence : UMR7645-MOBINT-K51003
Lieu de travail : PALAISEAU
Institut : INP - Institut de physique
Date de publication : mardi 2 décembre 2025
Session : Campagne Hiver 2026
Groupe de Fonction : IRG2
BAP : E - Informatique, Statistiques et Calcul scientifique
Emploi type : Experte ou expert en calcul scientifique

Missions

Prendre en charge la gestion de données de bio-imagerie obtenues lors d'expériences de microscopie multimodale : stockage, gestion, analyse automatisée et visualisation ainsi que ingénierie logicielle des outils développés.


Activités

- Prendre en charge l'analyse de données de certains projets, de la compréhension et la formalisation des besoins à la publication des résultats
- Diffuser, publier et valoriser les développements de méthodes d'analyse
- Gérer les moyens techniques et financiers alloués aux infrastructures de
stockage et de gestion des données d'imagerie du pôle Microscopie du LOB
- Mettre en place, en lien avec les avancées de la communauté sur le sujet, un format de donnée uniforme pour les images du pôle et leur métadonnées
- Concevoir des plugins de visualisation de données d'imagerie du pôle et former les personnels du pôle sur ces plugins
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique sur l'analyse
d'image, notamment en Intelligence Artificielle et sur la science ouverte
- Déployer des plans de gestion de données. Orienter et conseiller les utilisateurs de la plateforme d'imagerie Morphoscope (IBISA/FranceBioImaging) pour l'analyse des données
- Participer à des réseaux professionnels en analyse d'image et en science ouverte, dans le cadre de l'infrastructure nationale France BioImaging.


Compétences

Connaissances/Savoirs :
- Science des données/intelligence artificielle
- Bases de physique appréciées (instrumentation en microscopie)
- Bases de Biologie appréciées
- Notions d'anglais appréciées (niveau B1 du Cadre européen commun de référence pour les langues)

Compétences opérationnelles/Savoir-faire :
- Traitement du signal/des images
- Gestion de données massives
- Langages de programmation, en particulier en Python
- Génie logiciel (git, test unitaire, intégration continue
- Gestion d'infrastructure d'informatique scientifique

Savoir-être :
- Autonomie
- Curiosité intellectuelle
- Capacité de prospective
- Capacités d'analyse
- Savoir rédiger des rapports et des documents
- Connaître les techniques de communication
- Savoir piloter un projet


Contexte de travail

Le Laboratoire d'Optique et Biosciences est une structure mixte de recherche CNRS-INSERM-Ecole polytechnique composée d'environ 70 personnels (25 chercheurs/enseignants-chercheurs), 14 ITA, ~30 doctorants/post-doctorants), située sur le campus de l'Ecole polytechnique à Palaiseau. Il rassemble des compétences en biologie moléculaire et cellulaire, en optique et dynamique femtoseconde, dans le but de développer des synergies et de favoriser l'émergence de nouveaux concepts et outils, en particulier pour la compréhension du fonctionnement des biomolécules et de leur organisation au sein des cellules et
tissus.
L'ingénieur-e travaillera au sein du pôle "Microscopies avancées et physiologie des tissus" du LOB (composé de 12 chercheurs et 15 doctorants-post-doctorants) qui développe de nouvelles techniques de microscopie avec des applications à de nombreux problèmes complexes de biologie.
Il-elle sera directement rattaché-e hiérarchiquement au Directeur d'Unité.

Cette fonction ouvre droit à la perception de l'Indemnité de Référence pour les Informaticiens (IRI).