Ingénieur en analyse de données biologiques h/f

La personne est responsable en particulier du traitement de données immunogénétiques (immunoglobulines ou anticorps, récepteur T et protéines de la superfamille des immunoglobulines (IgSF).
Activités
- Définir le plan d'études et mettre en place les procédures de recueil et de contrôle des données issues des travaux de recherche en immunogénétique.
· Contribuer à l'analyse de nouveaux projets d'annotation et de biocuration et de bioinformatique au sein de l'équipe IMGT®.
· Réaliser l'analyse, l'expertise et le traitement des données de locus d'immunoglobulines et de récepteurs T (nouvelles espèces), et des protéines de la superfamille IgSF au sein de l'équipe IMGT®.
· Adapter si nécessaire les outils bioinformatiques aux besoins du projet d'annotation et de biocuration, de la mise en forme et du stockage des données.
· Alimenter les bases de données et contrôler leurs cohérences.
· Créer, modifier les pages Web dans le domaine
· Assurer la veille technique et scientifique
· Diffuser et valoriser des résultats sous formes de rapports ou d'études à usage des communautés professionnelles et scientifiques.

Compétences
- Connaissance dans le domaine de l'immogénétique, de la biologie moléculaire et de l'immunoinformatique
- Comprendre et interpréter une problématique dans le domaine
- Utilisation des sites biologiques et bioinformatiques (NCBI, ENSEMBL) et d'outils d'analyse et de recherche de données (BLAST, FASTA, ALIGN)
- Connaître un langage de programmation orienté web (HTML, CSS)
- Maîtriser les techniques de présentation (écrites et orales)
Connaissance des environnements Unix et Windows
- Anglais courant (lu, écrit, parlé)
- Savoirs-être : Membre d'equipe

Contexte de travail


Front. Immunol., 2020 May 5;11 :821doi : 10.3389/fimmu.2.
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Bibliographie pertinente
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- Sanchez Sanchez G., Emmrich S., Georga M., Papadaki A., Kossida S., Seluanov A., Gorbunova V., Vermijlen, D.
Invariant TCR natural killer-like effector T cells in the naked mole-rat.
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- Nguefack Ngoune V., Bertignac M., Georga M., Papadaki A., Albani A., Folch G., Jabado-Michaloud J., Giudicelli V., Duroux P., Lefranc MP., Kossida S.
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- Pégorier P., Bertignac M., Chentli I., Nguefack Ngoune V., Folch G., Jabado-Michaloud J., Hadi-Saljoqi S., Giudicelli V., Duroux P., Lefranc M.-P. and Kossida S.
IMGT® biocuration and comparative study of the T cell Receptor beta locus of veterinary species based on Homo sapiens TRB.
Front. Immunol., 2020 May 5;11 :821doi : 10.3389/fimmu.2.

Contraintes et risques

Travail sur ordinateur