Doctorant (h/f) sur financement européen - élucidation du mécanisme de l'inhibition de la métalloprotéase bmp1 par son inhibiteur endogène et développement d'une molécule anti-fibrotique

Informations générales

Intitulé de l'offre : Doctorant (H/F) sur financement Européen - Élucidation du mécanisme de l'inhibition de la métalloprotéase BMP1 par son inhibiteur endogène et développement d'une molécule anti-fibrotique
Référence : UMR5305-CATMOA-009
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 07
Date de publication : mercredi 24 septembre 2025
Type de contrat : CDD Doctorant
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 mai 2026
Quotité de travail : Complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2200,00 € mensuel (+ allocations de mobilité et familiales suivant situation personnelle)
Section(s) CN : 20 - Biologie moléculaire et structurale, biochimie

Description du sujet de thèse

Titre: Élucidation du mécanisme de l'inhibition de la métalloprotéase BMP1 par son inhibiteur endogène et développement d'une molécule anti-fibrotique

Introduction
BMP1 (Bone Morphogenetic Protein 1) est une métalloprotéase extracellulaire qui joue un rôle essentiel dans l'assemblage de la matrice extracellulaire et l'activation des facteurs de croissance. Elle intervient dans plusieurs processus physiologiques tels que le développement, la croissance et la cicatrisation des plaies cutanées. Cependant, une dérégulation de son activité peut entraîner des troubles pathologiques, notamment des troubles de la cicatrisation (par exemple, plaies chroniques et cicatrices). Le laboratoire de C. Moali s'intéresse à la compréhension des mécanismes de régulation de l'activité de BMP1, aux niveaux moléculaire, cellulaire et tissulaire, dans le but de développer des approches thérapeutiques innovantes pour traiter les troubles de la cicatrisation des plaies.

Contexte
Des travaux antérieurs ont montré que la régulation de la BMP1 repose sur deux protéines principales, PCPE1 et PCPE2, dont les fonctions se recoupent et divergent à la fois. Une différence majeure entre les protéines PCPE est que seule la PCPE2 peut inhiber l'activité protéolytique de BMP1. Cette découverte était inattendue, car PCPE1 et PCPE2 sont très similaires en termes de séquences et de structures.

Objectifs
Les principaux objectifs du projet de doctorat seront (i) d'élucider les bases moléculaires de l'inhibition de BMP1 par PCPE2 et (ii) d'utiliser ces connaissances pour concevoir une molécule anti-fibrotique capable de bloquer la maturation protéolytique du collagène par BMP1.

Méthodologie
Nous utiliserons une approche de sequence swapping entre PCPE1 et PCPE2 afin d'identifier les résidus importants pour la fonction inhibitrice de PCPE2 (biologie moléculaire, tests d'activité, résonance plasmonique de surface). En parallèle, nous tenterons de déterminer la structure du complexe BMP1/PCPE2 par cryo-microscopie électronique, à l'aide de Nanobodies développés précédemment dans le but de stabiliser les régions flexibles. Enfin, nous utiliserons les informations précédemment acquises pour concevoir un inhibiteur optimisé de BMP1, puissant, stable et spécifique, et testerons son potentiel thérapeutique dans un modèle de cicatrisation cutanée sur puce.

Résultats attendus
Ce projet permettra d'élucider un nouveau mécanisme d'inhibition des protéases et de développer un inhibiteur spécifique et puissant de BMP1 doté de propriétés antifibrotiques.

Compétences attendues pour les candidats:
- Master en biochimie et biologie structurale
- Expérience pratique dans au moins une des techniques suivantes : biologie moléculaire (PCR, clonage), culture de cellules mammifères, purification de protéines, méthodes d'analyse des interactions protéine-protéine (ELISA, SPR, BLI,, cristallographie, cryo-microscopie électronique
- Connaissances de base en biologie cutanée, protéases, matrice extracellulaire
- Excellente maîtrise de l'anglais (écrit et parlé)
- Compétences rédactionnelles
- Capacité à travailler en équipe et dans un contexte multiculturel
- Grande autonomie, sens de l'organisation, rigueur et réactivité

Contexte de travail

REMOD-HEALING est un réseau doctoral, de type Marie Sklodowska-Curie Action (MSCA-DN), financé par le programme Horizon Europe de l'Union européenne. Le consortium REMOD-HEALING dispose d'un financement pour 12 bourses doctorales à temps plein (100 %) (dans différents sites en Europe et au Costa Rica).

REMOD-HEALING est un réseau de recherche regroupant des scientifiques européens et latino-américains de premier plan issus du monde universitaire et de l'industrie, qui souhaitent aborder le problème des plaies pathologiques en exploitant les cibles thérapeutiques et les biomarqueurs associés au remodelage de la matrice extracellulaire. Grâce à ses activités de recherche et de formation, le projet REMOD-HEALING contribuera au progrès scientifique et à l'innovation dans le domaine de la cicatrisation des plaies et de la médecine régénérative. Cet effort coordonné et interdisciplinaire se traduira à terme par des avantages sociaux et économiques (plus d'informations seront bientôt disponibles sur le site web de REMOD-HEALING : .

La participation à REMOD-HEALING offre aux doctorants de nombreuses opportunités, notamment :
• Un projet de 36 mois en tant que doctorant Marie Skłodowska Curie dans l'une des institutions participantes, dans le but d'obtenir un diplôme de thèse (PhD).
• Des recherches de pointe au sein d'un consortium international menant des projets de recherche fortement intégrés.
• Une formation spécialisée en recherche fondamentale et appliquée, ainsi qu'une compréhension approfondie du processus de transition de la recherche fondamentale à la recherche préclinique.
• Une formation à la recherche dans le laboratoire d'un autre membre du consortium, d'une durée de quelques semaines à trois mois, effectuée dans un pays de l'UE autre que celui où se déroulera la majeure partie du projet.
• Une formation dans des environnements de recherche universitaires et industriels.
• Une rémunération conforme aux directives européennes pour les doctorants Marie Skłodowska Curie, y compris les indemnités de mobilité et les allocations familiales, le cas échéant.

Plusieurs summer/winter schools sont également prévues pour renforcer les connaissances des doctorants dans les domaines scientifiques mais aussi de l’innovation et des compétences transversales (communication scientifique, propriété intellectuelle, écriture de demandes de financements etc).

Le projet de thèse décrit ici se déroulera principalement au LBTI (Lyon, France), un laboratoire de 120 personnes spécialisé dans la recherche de pointe en biologie tissulaire et en développement de nouvelles stratégies thérapeutiques dans le domaine de la réparation tissulaire. Par ailleurs, le doctorant effectuera un stage de trois semaines à l'université de Manchester (Royaume-Uni) dans le laboratoire de Clair Baldock pour suivre une formation en cryo-microscopie électronique, puis un stage de trois mois chez Mimetas (Leiden, Pays-Bas) dans le laboratoire de Dorota Durek afin de tester un inhibiteur de protéase, obtenu par ingénierie des protéines, dans un modèle in vitro de cicatrisation cutanée.

Pour plus d'informations sur le projet scientifique, merci de vous référer au document suivant : https:///s/wHipMCHC77pgrsc


Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Les candidats ne doivent pas avoir résidé ou exercé leur activité principale (travail, études, dans le pays de l'établissement d'accueil pendant plus de 12 mois au cours des 36 mois précédant leur date de recrutement.
Le candidat sélectionné travaillera dans des laboratoires BSL2 et avec des produits chimiques de laboratoire. Les équipements de protection individuelle seront fournis par les laboratoires d'accueil.