Stage master 1 ou césure - identification des événements de prédation du bar européen en atlantique nord-est par analyses de données de biologging

Identification des événements de prédation du bar européen en Atlantique Nord-Est par analyses de données de biologging

Contexte :

Le biologging consiste à équiper des animaux sauvages de dispositifs électroniques enregistrant des variables environnementales et/ou physiologiques, afin d’étudier leurs déplacements, comportements et interactions dans leur milieu naturel (Watanabe and Papastamatiou 2023). Entre 2010 et 2022, les programmes BARGIP et FISHINTEL ont permis d’équiper plus de 1500 bars européens (Dicentrarchus labrax) en Manche et dans le Golfe de Gascogne avec des marques archives enregistrant température et pression (i.e. profondeur) toutes les 90 secondes pendant une période pouvant aller jusqu’à deux ans (de Pontual et al. 2023). A ce jour, environ 500 marques archives ont été récupérées après échouage sur les plages ou recapture des poissons par la pêche professionnelle ou récréative, permettant l’exploitation des séries temporelles collectées. L’analyse préliminaire des marques archives retrouvées sur les plages suggère qu’une proportion non négligeable des individus suivis aurait été prédatée. Certains enregistrements montrent en effet des changements rapides des régimes de pression et de température, compatibles avec un changement d’hôte (Rudd et al. 2024). Par exemple, une modification brutale des profils de plongée avec des remontées fréquentes en surface pourraient indiquer une ingestion par un mammifère marin respirant en surface régulièrement. Une augmentation et une stabilisation de la température enregistrée pourrait également suggérer une ingestion par un hôte endotherme. Ces signatures pourraient correspondre à une ingestion par différents prédateurs potentiels présents en Atlantique Nord-Est, tels que des cétacés, des pinnipèdes ou certains requins.

Les objectifs du stage sont :

1. Identifier, au sein de la base de données existante, les individus présentant une signature compatible avec un événement de prédation
2. Développer une approche analytique permettant de discriminer les profils de prédation
3. Proposer une identification des prédateurs potentiels sur la base des signatures de température et pression observées et de la littérature scientifique existante

Ce travail permettra d’élaborer des pistes de réflexion méthodologiques sur la détection et la classification des événements de prédation à partir des données de biologging du bar, et permettra d’identifier l’occurrence spatiotemporelle de ces évènements en Atlantique Nord-Est.

Références :

de Pontual H, Heerah K, Goossens J et al. Seasonal migration, site fidelity, and population

structure of European seabass (Dicentrarchus labrax). ICES J Mar Sci

2023:fsad087.

Rudd JL, Abel G, Baringo F et al. High-resolution biologging of an Atlantic bluefin tuna

captured and eaten by a supposed orca. Sci Rep 2024;14:29352.

Watanabe YY, Papastamatiou YP. Biologging and Biotelemetry: Tools for Understanding

the Lives and Environments of Marine Animals. Annu Rev Anim Biosci

2023;11:247–67.

Activités :

• Développement d’un algorithme permettant de distinguer les individus prédatés

• Analyse et visualisation de séries temporelles température/profondeur

• Interprétation écologique des signatures observées

• Recherche bibliographique et synthèse des connaissances

Compétences recherchées :

• Bonnes bases en analyses statistiques de séries temporelles

• Programmation sous R et/ou Python

• Intérêt pour l’écologie marine et l’analyse de données biologiques

• Rigueur, autonomie et capacité d’organisation

• Capacité rédactionnelle et esprit de synthèse

• Aptitude au travail en équipe

Conditions du stage :

• Encadrement : Marine Gonse (L3I, La Rochelle Université), Christophe Guinet

(Centre d’Etude Biologique de Chizé, CNRS/ La Rochelle Université) et Mathieu

Woillez (Ifremer, Brest)

• Durée : 2 mois (dates flexibles)

• Lieu : La Rochelle Université, Laboratoire Informatique, Image et Interaction

(Bâtiment Pascal, Avenue Michel Crépeau, 17042 La Rochelle)

• Indemnités : stage non gratifié (< 2 mois)

Les candidatures (CV et lettre de motivation) et toute demande d’informations

supplémentaires sont à adresser par email avant le 23 mars à : marine.gonse@univ-lr.fr