Assistant ingénieur en épigénétique moléculaire et développementale des plantes h/f

L'Assistant Ingénieur étudiera la fonction d'une protéine impliquée dans la répression chromatinienne, médiée par Polycomb PRC2, des gènes de développement chez les plantes. Les principaux objectifs sont de caractériser finement un facteur associé à PRC2 en incluant (i) des approches de génétique végétale et (ii) des approches de biochimie moléculaires. Pour ce faire, le chercheur aura pour mission de développer des approches moléculaires et génétiques ainsi que des outils pour les analyses épigénomiques/épigénétiques et intéractomiques.
Activités
L"AI développera son projet sous la supervision directe de C. Carles (PR UGA, responsable de l'équipe IIRIG-LPCV-ChromDev) et de J. Kadlec (chercheur INSERM dans l'équipe IRIG-IBS-EpiGen). Il/elle bénéficiera du contexte collaboratif entre les deux équipes, au sein du consortium ANR ChromSwitch. En particulier, la personne travaillera au quotidien en étroite interaction avec les ingénieures d'étude permanente en charge des travaux de génétique moléculaire végétale (M. Le Masson), et de biochimie (A-E. Foucher). Les activités pourront inclure :
- Caractérisation moléculaire de lignées transgéniques de plantes (phénotypage, expression de gènes - RT-qPCR -, et marques chromatiniennes -ChIP-qPCR-).
- Analyses in vitro d'interactions entre protéines et nucléosomes (DNA, histones) : EMSA, structure cryoEM En outre, l'AI présentera ses données en anglais lors de réunions d'équipe et participera à l'analyse d'articles scientifiques liés à sa recherche, et les discutera avec les membres de l'équipe (e.g. « journal clubs »).
Compétences
Le candidat doit avoir un profil adéquat pour développer des approches de biologie moléculaire et de génétique végétale pour les analyses épigénomiques/épigénétiques et intéractomiques. Le candidat doit :
- Maîtriser les bases (théorie et pratique) de la génétique/épigénétique et de la biologie moléculaire.
- Être familiarisé avec les méthodes d'analyse et de mesure de l'expression des gènes et des marques épigénétiques, et leur exploitation bioinformatique.
- Être autonome dans l'interprétation et la présentation des résultats lors de réunions d'équipe et de séminaires - développer des outils et des méthodes et les utiliser de manière fiable et reproductible.
- Être capable de contribuer à la préparation de publications scientifiques.
- Être capable de travailler de manière indépendante dans un environnement interdisciplinaire et international - être prêt à interagir scientifiquement au sein d'un groupe de recherche dynamique - respecter les règles et les procédures du laboratoire - parler couramment l'anglais.
Contexte de travail

L'AI fera partie de l'équipe ChromDev (http://www.lpcv.fr/en/ChromDev) du Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale (UMR 5168 - CNRS -CEA - Univ. Grenoble Alpes - INRAE) et de l'équipe EpiGen de l'Institut de Biologie Structurale (https://www.ibs.fr/fr/recherche/assemblage-dynamique-et-reactivite/groupe-epigenetique-et-voies-moleculaires-c-petosa/equipe-kadlec/), à Grenoble. Les projets de ces équipes visent à mieux comprendre les dynamiques chromatiniennes qui régulent les transitions développementales, en utilisant une stratégie multidisciplinaire, qui englobe des analyses phénotypiques in vivo, des études omiques (épigénomique, transcriptomique, intéractomique) et la caractérisation in vitro des interactions moléculaires et des structures 3D des complexes protéiques. Ce poste sera à pourvoir sur le campus du Polygone à Grenoble, un environnement riche pour la recherche en biologie, à proximité de plusieurs laboratoires tels que l'IBS, l'IRIG, l'ESRF et l'EMBL. L'institut LPCV emploie une centaine de personnes et dispose d'équipements de pointe en biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale et imagerie. Il dispose d'installations de culture de plantes permettant de réaliser toutes les étapes de la génétique moléculaire sur Arabidopsis.
Contraintes et risques L'AI travaillera, selon un agenda prédéfini, dans les deux équipes voisines, ci-dessus mentionnées (ChromDev, LPCV et Epigezn, IBS). Il/elle suivra les horaires entendus selon les modalités du contrat (temps plein), sur les créneaux réguliers d'ouverture des centres correspondants.