Retour à la liste des résultats
Présentation INRAE
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
Environnement de travail, missions et activités
Description de l’environnement de travail et des missions confiées: Vous exercerez votre activité dans l'unité Interactions Arbres-Microorganismes (UMR 1136 IAM) au sein de l’équipe « Ecogénomique des interactions ». L’équipe se compose de 15 agents permanents, et une vingtaine d’agents non permanents. L’équipe étudie les mécanismes moléculaires impliqués dans les interactions sol/arbres/microorganismes (bactéries, champignons) et l’écologie des microorganismes des sols forestiers. Les activités scientifiques intègrent différentes échelles allant du gène à l’organisme et de l’organisme à l’écosystème. L’équipe Ecogénomique est localisée sur le Centre INRAE Grand Est Nancy, à Champenoux. Vous développerez des solutions logicielles et les bases de données génomiques nécessaires pour réaliser des analyses d'inférences fonctionnelles de données de métagénomique amplicon.
Descriptif du programme et de ses acteurs :
Le programme PEPR exploratoire FairCarboN réunit la communauté scientifique française étudiant le carbone dans les écosystèmes continentaux, etdoit permettre de préciser la contribution possible des écosystèmes continentaux à l’atténuation du changement climatique, sans laquelle l’objectif de l’accord de Paris sur le climat n’est pas atteignable. Au sein de FairCarboN, l'objectif du projet CANETE est d'évaluer et de prédire les réponses physiologiques microbiennes auxpratiques de gestion agricole et forestière dans différents contextes pédoclimatiques, les conséquences surle couplage et le découplage entre les cycles du carbone, de l'azoteet du phosphore, notamment sur le stockage du carboneet desnutriments dans le sol, la fourniture de nutriments aux plantes et la production végétale.
Principales missions :
La personne recrutée contribuera à l’analyse des données de diversité microbienne des échantillons de sol du projet CANETE (PEPR FairCarboN). En concertation avec l’équipe projet, elle sera plus particulièrement investie dans les missions suivantes:
1. Développement d’une base de données fongiques dans un format compatible avec des analyses d’inférence fonctionnelles
2. Mise en place et évaluation d’une méthodologie d’inférence fonctionnelle pour les données du projet, fongiques et bactériennes
3. Traitement des données de métagénomique amplicon (diversité et inférences fonctionnelles)
4. Analyse biostatistique des résultats obtenus
5. Participation aux réunions du projet, transfert des résultats obtenus aux autres membres du projet, et notamment aux autres WP qui prévoient de les exploiter
6. Diffusion des travaux réalisés et des résultats obtenus (écriture de rapports, participation à la rédaction d’articles scientifiques, présentations orales)
Déplacements ponctuels, d’un à quelques jours, possibles sur la France entière (réunions, séminaires, congrès). Travail sur écran (ordinateur)...
Formations et compétences recherchées
Master/Ingénieur (Bac+5)
* Connaissances souhaitées : écologie microbienne, métagénomique amplicon, voies métaboliques, analyses biostatistiques
* Expérience en exploitation de données omiques. Expérience avec les logiciels FROGS et PICRUST appréciée.
* Aptitudes recherchées :
o Maîtrise du langage bash et d’un langage de programmation (perl ou python)
o Maîtrise du langage R pour la manipulation de données tabulaires, la réalisation d’analyses biostatistiques et de figures
o Bonne maîtrise du français et de l’anglais
o Esprit méthodique et bonnes compétences organisationnelles
o Qualités relationnelles et bonnes aptitudes au travail en équipe et en réseau
o Curiosité scientifique
Votre qualité de vie à INRAE
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :
- jusqu'à30 jours de congés+ 15 RTTpar an (pour un temps plein)
- d'un soutienà la parentalité : CESUgarded'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences: formation, conseilen orientation professionnelle ;
- d'un accompagnementsocial : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestationsvacancesetloisirs :chèque-vacances,hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activitéssportivesetculturelles ;
- d'unerestaurationcollective.
Modalités pour postuler
J'envoie mon CV et ma lettre de motivation
Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr
En cliquant sur "JE DÉPOSE MON CV", vous acceptez nos CGU et déclarez avoir pris connaissance de la politique de protection des données du site jobijoba.com.