Ingénieur d'études en bioinformatique (h/f)

Vos missions en quelques mots Missions : Nous recrutons une ingénieure / un ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nuclei RNA-seq générées à partir d’un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d’émergence au sein d’un embryon aviaire (Delloye-Bourgeois et al., Cancer Cell, 2017 ; Villalard et al., Nat Commun, 2024) Activités : • Analyse et traitement des données single-nuclei RNA-seq. • Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients publiques ou des nouvelles données issues de collaborations. • Application de méthodes bio-informatiques pour l’annotation cellulaire, l’identification de sous-populations, l’analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d’enrichissement en processus biologiques etc. • Collaboration étroite avec les biologistes de l’équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses ainsi qu’avec les autres bioinformaticiens ou bioinformaticiennes de l’équipe ou d’équipe collaboratrice • Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité. • Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques. Contexte de travail : • Contrat : CDD de 12 mois à partir du 4 mai 2026. • Rémunération : Selon la grille CNRS (selon expérience). • Environnement : o Intégration dans une équipe d’environ 14 personnes, au sein du groupe thématique d’étude du neuroblastome. o Collaboration avec des équipes partenaires de divers instituts. o 44 jours de congés/RTT par an. o Horaires flexibles et bureaux confortables. o Remboursement partiel des transports (75%) forfait mobilité durable (jusqu’à 300€/an). o Participation financière à la mutuelle. o Site accessible en transports en commun. Profil recherché Competences : • Formation : Master ou diplôme d’ingénieur en bioinformatique, biostatistiques souhaité. Une expérience confirmée en analyse de données single-cell ou single-nuclei RNA seq est indispensable. • Compétences techniques : -Maîtrise de R/Python et des outils d’analyse single-cell (Seurat, CellChat, GSEA, etc.). -Utilisation de GitHub pour la gestion de codes. -Anglais lu, écrit et parlé (pour la lecture de publications et les collaborations). • Qualités personnelles : Rigueur, autonomie, prise d’initiative et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire Contraintes et risques : Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français Seuil