Concevoir, développer et maintenir des pipelines d?analyse en Python (idéalement avec Snakemake) pour automatiser et orchestrer les traitements bio-informatiques.
Industrialiser et fiabiliser les environnements de production à l?aide d?outils d?infrastructure as code (Terraform) et d?intégration continue (GitLab CI/CD).
Mettre en place et superviser le déploiement des solutions logicielles sur des environnements Linux et Cloud AWS, en veillant à la sécurité et à la performance.
Gérer et optimiser les conteneurs et images Docker pour faciliter la reproductibilité et la portabilité des outils internes.
Contribuer à la structuration et à la maintenance des bases de données internes (sécurisation, sauvegarde, interfaçage avec les outils d?analyse).
Apporter un support technique et méthodologique à l?équipe bio-informatique pour renforcer les bonnes pratiques de développement, de versioning et de documentation.
Conseiller et accompagner les équipes internes dans l?évolution des architectures logicielles, le choix des outils et la montée en maturité DevOps.
Profil candidat:
Compétences techniques attendues :
Développement de pipelines Python (idéalement avec Snakemake) pour automatiser et orchestrer des analyses.
Solide maîtrise des environnements Linux et du cloud AWS et leur gestion sécurisée.
Expertise dans la gestion d?infrastructures avec Terraform et GitLab CI/CD.
Compétence en déploiement de logiciels sur serveurs Linux et environnements AWS.
Connaissance et pratique de Docker pour le packaging et le déploiement d?applications.
Contribuer à la gestion et à l?utilisation de banques de données (sécurisation, mise à jour, interfaçage).
Qualités attendues :
Capacité à s?intégrer rapidement dans une équipe et à travailler en autonomie.
Aptitude à proposer des solutions pragmatiques et à documenter clairement les processus.
Approche orientée résultats et respect des délais.
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