Vos missions en quelques mots Missions : Dans le contexte d'un plateau de microscopie fonctionnant en laboratoire confiné de sécurité biologique de niveau 3 (NSB3) sur la plateforme d’infectiologie CEMIPAI, l'ingénieur de recherche organisera le service d’imagerie photonique 4D en lien avec les autres services et les utilisateurs de la plateforme. En particulier, il participera à la mise en place, au développement, à l’entretien des microscope Lattice Light Sheet et Spinning-Disk du plateau NSB3. Il accompagnera, formera, conduira et développera en spécialiste les acquisitions et les traitements d’image adaptés aux questions scientifiques et techniques posées par les utilisateurs. Activités : • Mettre en place un nouveau service de microscopie volumétrique dans le laboratoire NSB3 via l’installation et la mise en exploitation d’un nouveau microscope Lattice Light Sheet (LLSM) dédié à l’imagerie 4D de cultures cellulaires 2D & 3D, sphéroïdes, organoïdes et organismes modèles en trois dimensions. • Assurer le support technique, accompagner et former les utilisateurs sur le microscope spinning-disk, en lien avec leurs questions biologiques. • Assurer le bon fonctionnement du parc des microscopes volumétriques (LLSM et Spinning-Disk) ainsi que le développement de l'offre de prestations • Accompagner et initier des projets en microscopie du vivant infectieux en microscopie volumétrique LLSM et Spinning-Disk en NSB3 • Organiser et faire évoluer l’offre, le parc matériel et logiciel, la gestion et la facturation du service • Assurer les bonnes conditions d'utilisation et de sécurité pour les utilisateurs et les appareils en environnement NSB3 • Implémenter de nouvelles modalités d’imagerie volumétrique, particulièrement le déploiement de solutions dédiés aux cultures cellulaires 3D, organoïdes et embryons (de l’acquisition à l’analyse des données) et leur utilisation dans des recherches en infectiologie, de l’exposome et de leur combinaison. • Mettre en œuvre des méthodes d’analyse de traitement du signal et de traitement d’images pour répondre aux besoins de recherche des utilisateurs • Développer et réaliser des contrats de prestations privés et publics • Participer à des réseaux professionnels d'échanges et de savoir-faire techniques dans le domaine de la microscopie volumétrique • Assurer une veille scientifique et technologique et participer aux réseaux métiers (GDR, FBI, EUBI) • Gérer, maintenir et faire évoluer le parc matériel et logiciel, suivre quotidiennement l'exploitation • Rédiger des rapports d’expérience ou de prestation, des notes techniques • Assurer l’application des principes et des règles d’hygiène et de sécurité en environnement NSB3 • Diffuser et valoriser les résultats des développements méthodologiques par des présentations orales, la production de publications… Contexte de travail : L'ingénieur sera en poste sur le plateau d'imagerie NSB3 de la plateforme régionale CEMIPAI, sur le campus CNRS ro Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr Profil recherché Competences : • Connaissances théoriques et pratiques approfondies en microscopie volumétrique par feuille de lumière structurée (lattice light sheet) et microscopie confocale Spinning Disk • Savoir-faire opérationnel en microscopie à feuille de lumière structurée et microscopie confocale Spinning Disk • Maîtrise de l’outil informatique et des logiciels de traitement et analyse d’images tels que ImageJ, Imaris … • Bio informatique et programmation avec logiciels scientifiques (R, Matlab, Python) • Métrologie • Capacité à communiquer en français et en anglais (niveau B2) avec des publics variés (étudiants, ITA, chercheurs, privés, commerciaux) • Savoir coordonner différents projets en parallèle • Gérer les relations avec les interlocuteurs de la plateforme • Savoir rédiger des rapports, notes techniques, publications • Savoir valoriser des résultats, effectuer des présentations • Connaissance des réglementations du domaine en hygiène et sécurité • Capacité à travailler en équipe, dynamisme, autonomie • Goût du contact et de l’échange avec les utilisateurs du plateau technique Contraintes et risques : Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français Seuil
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