Description
CONTEXTE :
L’AI (H/F) sera intégré(e) pour la partie biologie de sa mission au sein de la sous-équipe « Fonction du récepteur nucléaire des hormones thyroïdiennes TRα1 dans la physiopathologie des cellules souches intestinales » dirigée par le Dr Michelina Plateroti a l’IGBMC.
La personne recrutée participera à la modélisation mathématique des études sur la biologie des cellules souches et des cancers intestinaux. Ces études sont menées sur des modèles murins génétiquement modifiés et utilisent des approches de microscopie et imagerie.
MISSIONS:
* Préparation et analyse des échantillons biologiques, cultures d’organoïdes et coupes de tissus ;
* Immunofluorescence et imagerie confocale ;
* Analyse des images : normalisation, segmentation
* Extraction des données biologiquement pertinentes : statistiques globales et spatialisées.
* Analyses statistiques globales sur les données extraites.
* Planifier, réaliser et analyser les expérimentations en concertation avec le(s) supérieur(s) hiérarchique(s) en suivant les procédures établies dans les règles d’hygiène et sécurité adéquates ; rédiger les protocoles associés.
* Assurer la gestion/traçabilité des échantillons et des données expérimentales.
* Gérer de manière autonome la répartition de son temps de travail entre les différentes missions.
* Participer à la vie des laboratoires (gestion des stocks, commandes, maintenance appareillage, tâches d’intérêt général...).
ACTIVITES:
Activités principales
* Préparation et analyse des échantillons biologiques, cultures d’organoïdes et coupes de tissus ;
* Immunofluorescence et imagerie ;
* Analyse des images et modélisation mathématique.
Activités associées
* Aide au génotypage des souriceaux
* Dont activités d’encadrement et d’animation :
* Participation à la formation des étudiants stagiaires et aux bonnes pratiques du laboratoire.
Activité spécifique ou d’intérêt collectif :
Participer à la vie du laboratoire (gestion des stocks, commandes, maintenance appareillage, tâches d’intérêt général...).
ENVIRONNEMENT ET CONTEXTE DE TRAVAIL :
Unité d’affectation : UMR 5669, ENS de Lyon et UMR 7104, IGBMC Illkirch
Encadrant hiérarchique direct avec conduite de l’entretien annuel : David Coulette, ENS de Lyon.
Encadrante en biologie : Michelina PLATEROTI, IGBMC.
Directeurs d’unité : Frédéric Déglise, ENS de Lyon et Patrick SCHULTZ, IGBMC
Contexte d’exercice du poste : L’AI (H/F) travaillera en contact étroit avec deux laboratoires de recherche.
Le recrutement sera effectué par l’ENS de Lyon et sous la direction du Dr David Coulette.
Les travaux de biologie et d’imagerie, nécessaire à la modélisation mathématique, seront effectués à l’IGBMC (https://www.igbmc.fr/igbmc) et l’AI bénéficiera d'un environnement scientifique international (une quarantaine d’équipe divisées en 4 départements scientifiques) et des plateformes technologiques présentes sur le site.
L’IGBMC est affiliée au CNRS, à l'INSERM et à l'Université de Strasbourg.
Personnes à contacter :
David Coulette :david.coulette@ens-lyon.fr
Michelina Plateroti :platerom@igbmc.fr
Profil recherché
COMPÉTENCES REQUISES :
* Niveau d’études souhaité : Bac+3
* Expérience souhaitée : 1 à 3 ans
* Connaissances sur l’environnement professionnel
* Culture cellulaire ;
* Immunomarquage ;
* Microscopie et analyse d’images ;
* Méthodes et outils d’analyse statistiques
Savoir-faire opérationnels
* Capacité de prise en main en toute autonomie des protocoles ;
* Méthodes et outils de traitement d’images (ImageJ, scikit-image, ...)
Savoir Être
* Rigueur
* Organisation
* Motivation
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