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Présentation INRAE
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
Environnement de travail, missions et activités
Vous serez accueilli(e) au sein de l’équipe ‘Rooti’ (pour Root interactions) de l’UMR ‘Ecophysiologie et GénomiquefonctionnelledelaVigne’(EGFV)ainsiquedansl’UMR‘SantéetAgroécologieauVignoble’(SAVE) sur le site INRAE de Nouvelle Aquitaine-Bordeaux (Villenave d’Ornon). Les UMR EGFV et SAVE collaborent sur l’étudedumicrobiomede lavigneetont pourobjectifcommun d’identifier les traitsde laplanteenlien avec les biomarqueurs microbiens de l’état de santé des écosystèmes viticoles.
VousinterviendrezdansleprogrammederecherchePARSADAGetUp,quiapourobjectifdedévelopperdes stratégies de biocontrôle du mildiou, basées sur la gestion du microbiote de la vigne ( ). Vous étudierez l’effet du génotype de porte-greffe sur la présence de microorganismes potentiellement protecteurs contre le mildiou, dans les compartiments racinaires (rhizosphère et racines) et aériens (bois et feuilles) (AR6 du projet). Les prélèvements seront réalisésen2026 sur laparcelleGreffAdaptcultivéesurlesite de l’UE ‘Vigne&Vin Bordeaux’.Unequinzaine de porte-greffes et trois cépages ont été sélectionnés afin d’étudier la composition des microbiomesdes différentscompartimentsviadifférentesapproches(metabarcoding,dPCRetpucesFluidigm).Apartirdece premier jeu de données, une deuxième série de prélèvementset d’analyses sera effectuée en 2027 sur une sélection de combinaisons cépage/porte-greffe favorisant des associations avec des microorganismes candidats de biocontrôle, afin de confirmer les résultats. La puce Néovigen sera utilisée pour évaluer l’expression des gènes de défense de la plante en fonction des porte-greffes et des microbiotes associés ( ), dans l’objectif d’identifier les processus moléculaires impliqués.Vousparticiperezégalementàl’AR1enanalysantlescommunautésdechampignonsmycorhiziens à arbuscules, par des approches de type metabarcoding, dans des racines de plants prélevés dans des parcelles contrastées en termes de symptômes de mildiou, issues de cinq régions viticoles.
Vous valoriserezvos résultats sousforme de communications scientifiques et techniques. Vous participerez à des actions de transfert vers la profession via la contribution à des articles de vulgarisation des résultats scientifiques. Vous contribuerez à l’encadrement d’un.e technicien.ne qui sera recruté.e sur cette thématique.
* Vousserezplusparticulièrementenchargede:
* Formulerdeshypothèsesderecherchepouvantêtretestéesaveclesjeuxdedonnéesdéjàacquis;
o Effectuerunsuiviexpérimentaletdescampagnesdeprélèvementssurlesdifférentesparcelles;
o Encadrerun.etechnicien.neetréaliserlesanalysesmoléculairesaulaboratoire;
o Réaliser les analyses bioinformatiques et biostatistiques des jeux de données préliminaires et ceux obtenus lors des expérimentations en cours, permettant de tester les hypothèses ;
* Rédigerlespublicationscorrespondantes;
o Communiquerlesrésultatsobtenusdanslesréunionsdeprojetetdesconférences;
o Contribueràlaviescientifiquedesdeuxéquipes,enparticipantauxanimationsetenpartageantvos connaissances et vos compétences ;
* travailenlaboratoire,travailsurécran;déplacementsen Champagne, Val de Loire, Cognac ; prélèvements sur le terrain
Formations et compétences recherchées
Doctorat/Ingénieur grandes écoles
* Formationrecommandée:Thèseenécologiemicrobienne,oueninteractionplante-microorganismes.
* Connaissances souhaitées: Connaissances sur le microbiome des plantes et ses méthodes
d’analyse(metabarcoding);biostatistiques.
* Expérienceappréciée:ProgrammationR,analysemetabarcoding,utilisationd'uneinfrastructurede calcul type HPC et git/gitlab pour la gestion de projet d’analyse.
* Aptitudesrecherchées:Rigueur,motivation,espritd’équipeetbonrelationnel.PermisB.
Votre qualité de vie à INRAE
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :
- jusqu'à30 jours de congés+ 15 RTTpar an (pour un temps plein)
- d'un soutienà la parentalité : CESUgarded'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences: formation, conseilen orientation professionnelle ;
- d'un accompagnementsocial : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestationsvacancesetloisirs :chèque-vacances,hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activitéssportivesetculturelles ;
- d'unerestaurationcollective.
Modalités pour postuler
J'envoie mon CV et ma lettre de motivation
Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr
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