Activité de recherche expérimentale en physique de la matière molle.
Activités
Le candidat utilisera un dispositif expérimental original qui permet de suivre, de manière résolue dans le temps et dans l'espace, la propagation des enzymes dégradant les polymères (à l'aide de l'imagerie par fluorescence) dans la matrice biopolymère, ainsi que les changements concomitants dans la dynamique des polymères (à l'aide de l'imagerie par corrélation de photons, une méthode avancée de diffusion dynamique de la lumière). Il fera varier les propriétés biomoléculaires (par exemple l'affinité pour le polymère) des enzymes, leur confinement dans la matrice biopolymère, ainsi que la structure et la viscoélasticité de la matrice biopolymère (par exemple en utilisant des solutions viscoélastiques et/ou des gels) afin d'élucider le couplage entre la dégradation du biopolymère et la propagation de l'enzyme dans un milieu dégradé par l'enzyme.
Le candidat travaillera en étroite collaboration avec l'ensemble des partenaires du projet CATCHY.
Compétences
Nous recherchons un candidat motivé ayant une solide formation en physique de la matière condensée, en matière molle ou en science des matériaux. Une expertise en optique, en techniques de diffusion de la lumière, en analyse de données avec Python et/ou en biopolymères est un plus, mais n'est pas obligatoire.
Contexte de travail
Le projet s'inscrit dans le cadre d'un projet interdisciplinaire (CATCHY) financé par l'Agence nationale de la recherche (ANR).
Une grande variété de processus biologiques, ainsi que de nombreuses innovations récentes en pharmacologie et en biotechnologie, reposent sur la déconstruction d'une matrice polymère viscoélastique par des enzymes dégradant les polymères. La dégradation est directionnelle, avec un front qui se déplace avec le temps à mesure que les enzymes
se propagent dans la matrice. L'objectif fondamental de CATCHY est de comprendre les paramètres physiques et biochimiques qui contrôlent la cinétique de la dégradation enzymatique dans ce contexte. La question centrale, mais souvent négligée, est de savoir comment les propriétés biomoléculaires et l'activité locale des enzymes influencent leur progression globale dans le système. Cette question se situe à l'interface entre la physique des matières molles, la physique chimique et l'enzymologie. Pour y répondre avec succès, CATCHY rassemble des chercheurs issus de ces différentes communautés dans le cadre d'une approche transdisciplinaire unique qui combine des techniques optiques et de diffusion de la lumière de pointe, des simulations de dynamique moléculaire et une solide expertise en ingénierie enzymatique.
Les travaux seront menés au sein de l'équipe Soft Matter du Laboratoire Charles Coulomb à Montpellier, en France (https://www.softmatter-l2c.fr/), sous la supervision de Laurence Ramos et Luca Cipelletti. Le candidat travaillera en étroite collaboration avec l'ensemble de l'équipe du projet, qui comprend des experts en simulations numériques, en biopolymères et en enzymologie, basés aux laboratoires IATE (Montpellier) et TBI (Toulouse).
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Le projet s'inscrit dans le cadre d'un projet interdisciplinaire (CATCHY) financé par l'Agence nationale de la recherche (ANR).
Une grande variété de processus biologiques, ainsi que de nombreuses innovations récentes en pharmacologie et en biotechnologie, reposent sur la déconstruction d'une matrice polymère viscoélastique par des enzymes dégradant les polymères. La dégradation est directionnelle, avec un front qui se déplace avec le temps à mesure que les enzymes
se propagent dans la matrice. L'objectif fondamental de CATCHY est de comprendre les paramètres physiques et biochimiques qui contrôlent la cinétique de la dégradation enzymatique dans ce contexte. La question centrale, mais souvent négligée, est de savoir comment les propriétés biomoléculaires et l'activité locale des enzymes influencent leur progression globale dans le système. Cette question se situe à l'interface entre la physique des matières molles, la physique chimique et l'enzymologie. Pour y répondre avec succès, CATCHY rassemble des chercheurs issus de ces différentes communautés dans le cadre d'une approche transdisciplinaire unique qui combine des techniques optiques et de diffusion de la lumière de pointe, des simulations de dynamique moléculaire et une solide expertise en ingénierie enzymatique.
Les travaux seront menés au sein de l'équipe Soft Matter du Laboratoire Charles Coulomb à Montpellier, en France (https://www.softmatter-l2c.fr/), sous la supervision de Laurence Ramos et Luca Cipelletti. Le candidat travaillera en étroite collaboration avec l'ensemble de l'équipe du projet, qui comprend des experts en simulations numériques, en biopolymères et en enzymologie, basés aux laboratoires IATE (Montpellier) et TBI (Toulouse).
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques
aucun risque identifié
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