Le chercheur/La chercheuse recruté(e) contribuera au développement d’un projet de recherche centré sur l’étude mécanistique de métalloprotéines appartenant à la superfamille des enzymes à radical s-adenosyl méthionine (SAM). Les enzymes étudiées sont impliquées dans des processus métaboliques variés tels que la biosynthèse de cofacteurs, la modification de peptides, des modifications post traductionnelles, la biosynthèse d’antibiotiques, et fonctionnent selon un mécanisme radicalaire utilisant un agrégat 4Fe4S qui clive de manière réductrice la SAM. Le chercheur / La chercheuse recruté(e) rejoindra le laboratoire de bioénergétique et ingénierie des protéines (BIP - CNRS et Aix Marseille Université) situé sur le campus CNRS à Marseille. Il/Elle sera intégré(e) à l’équipe de Biophysique des métalloprotéines et systèmes dynamiques reconnue en particulier pour ses travaux sur les métalloprotéines par les techniques de spectroscopie RPE.
Activités
Le chercheur/La chercheuse recruté(e) caractérisera par spectroscopie ces enzymes préparées dans différentes conditions au travers de l’étude de leurs cofacteurs métalliques à base de Fer ou de Cobalt retrouvés dans ces enzymes, ou de celle d’intermédiaires catalytiques radicalaires piégés. Pour cela, il/elle utilisera différentes techniques de spectroscopie de résonance paramagnétique électronique (RPE) (onde continue, mode pulsé, multifréquence). L’accent sera mis sur l’étude détaillée de la structure et de l’environnement des espèces paramagnétiques par les techniques impulsionnelles de spectroscopies hyperfines (ENDOR, ESEEM/HYSCORE) multifréquences.
Ce travail sera complété par l’analyse quantitative systématique des données expérimentales par simulation spectrale, en combinaison avec l’utilisation de différents substrats ou analogues, enrichis ou pas en isotopes magnétiques (2H, 13C, 15N, …) afin de décrypter différentes étapes de la catalyse.
Compétences
Docteur en (Bio)physique ou chimie, ayant soutenu une thèse dans laquelle la RPE a joué un rôle majeur, le candidat/la candidate aura une solide expérience des différentes techniques de RPE et en particulier des spectroscopies hyperfines, ainsi que de la simulation spectrale (Easyspin, Matlab). Une expérience dans la préparation d’échantillons en anaérobie, dans l’électrochimie ou dans la modélisation quantique (DFT) sera appréciée.
Le chercheur/chercheuse recruté(e) devra montrer une réelle capacité au travail indépendant (réflexion, bibliographie,…) dans un environnement multidisciplinaire et collaboratif, un esprit d’équipe ainsi que de bonnes compétences en communication en anglais et pour la rédaction d’articles scientifiques. Des bases en français seront un plus mais ne sont pas obligatoires. Une participation à la réalisation d’activités de vulgarisation scientifique, de formation à la spectroscopie RPE et/ou à l’encadrement de stagiaires (Licence ou Masters) ou de doctorants pourra être également demandée.
Contexte de travail
Le chercheur/La chercheuse recruté(e) sera intégré(e) au laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines (BIP) qui est une unité mixte de recherche CNRS/Aix Marseille Université intégrée à l’Institut de Microbiologie de la Méditerranée (CNRS FR3479) et à l’Institut Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie (IM2B) d’AMU. Le BIP développe des recherches dans le domaine de la bioénergétique des microorganismes, du niveau moléculaire au niveau cellulaire.
Le travail du chercheur/de la chercheuse s’insèrera dans un projet collaboratif localement piloté par le Dr. Stéphane Grimaldi au sein de l’équipe de Biophysique des métalloprotéines et systèmes dynamiques et mené en partenariat étroit avec l’équipe ChemSyBio de l’Institut MICALIS (INRAE/Université Paris Saclay). Ce projet est soutenu par plusieurs contrats avec l’Agence Nationale de la Recherche. Au BIP, le chercheur/la chercheuse bénéficiera en particulier des équipements permettant la manipulation anaérobie des enzymes à radical SAM, leur caractérisation rédox ainsi que l’instrumentation de spectrométrie RPE de pointe disponible au sein du pôle de spectrométrie RPE d’Aix Marseille hébergé par l’unité, l’un des principaux sites nationaux de spectrométrie RPE et rattaché à l’infrastructure de recherche en chimie analytique Infranalytics (CNRS FR2054).
Le chercheur/La chercheuse recruté(e) sera intégré(e) au laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines (BIP) qui est une unité mixte de recherche CNRS/Aix Marseille Université intégrée à l’Institut de Microbiologie de la Méditerranée (CNRS FR3479) et à l’Institut Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie (IM2B) d’AMU. Le BIP développe des recherches dans le domaine de la bioénergétique des microorganismes, du niveau moléculaire au niveau cellulaire.
Le travail du chercheur/de la chercheuse s’insèrera dans un projet collaboratif localement piloté par le Dr. Stéphane Grimaldi au sein de l’équipe de Biophysique des métalloprotéines et systèmes dynamiques et mené en partenariat étroit avec l’équipe ChemSyBio de l’Institut MICALIS (INRAE/Université Paris Saclay). Ce projet est soutenu par plusieurs contrats avec l’Agence Nationale de la Recherche. Au BIP, le chercheur/la chercheuse bénéficiera en particulier des équipements permettant la manipulation anaérobie des enzymes à radical SAM, leur caractérisation rédox ainsi que l’instrumentation de spectrométrie RPE de pointe disponible au sein du pôle de spectrométrie RPE d’Aix Marseille hébergé par l’unité, l’un des principaux sites nationaux de spectrométrie RPE et rattaché à l’infrastructure de recherche en chimie analytique Infranalytics (CNRS FR2054).
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