Pour répondre à ses objectifs, le LEPSE développe avec ces partenaires des chaines de traitement, d'analyse et de simulation de données à différentes échelles spatiales et temporelles issues de plateformes de phénotypage, de capteurs connectés, et de mesures manuelles. Ces chaines de traitement sont intégrées dans des systèmes d'information basés sur des ontologies et ressources sémantiques. En tant qu'ingénieur(e) d'étude vous aurez pour mission de développer des méthodes et outils de représentation et de gestion de flux de données permettant d'alimenter les analyses et modélisation conduites au laboratoire.
Pour cela vous :
- Développerez une application permettant de faciliter la saisie des données dans un format standardisé suivant un schéma de données reposant sur un vocabulaire standardisé;
- Développerez des parseurs et services web pour alimenter des systèmes d'information et extraire ces données pour alimenter des modèles de simulation;
- Constituerez et ferez évoluer des ressources sémantiques pour faciliter l'interopérabilité et la gestion des données de phénotypage ainsi que la composition sémantique de modèles de simulation;
- Effectuerez des tests de performance (profilage de codes) et optimiserez le code (refactorisation, multithreading et parallélisation de processus) d'un modèle de simulation pour l'exécution de grands plans de simulation sur des clusters de calcul;
· documenterez le processus de développement ainsi que ses caractéristiques techniques.
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