Sous la responsabilité d'une chercheure à l'IRD spécialiste en microbiologie, votre mission à consistera à choisir, adapter et mettre en oeuvre les méthodes nécessaires à la réalisation des activités de recherche de l'UMR dans le domaine de l'écologie microbienne moléculaire vos activités seront les suivantes : Assurer la veille méthodologique et la mise au point de méthodes en métagénomique (écologie synthétique, cultures microbiennes, approches " méta-omiques ", préparation, suivi et contrôle des opérations de fermentation). Réaliser des analyses de routine en biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel, séquençage à haut débit). Conduire les analyses de données issues du séquençage à haut débit (métagénomes alimentaires et intestinaux) en utilisant des outils de bio-informatique (Qiime 2, R, Python, Bash) y compris sur des clusters de calcul, du traitement des données à la visualisation. Favoriser l'articulation avec les structures opérationnelles et décisionnelles (plateformes de séquençage à haut débit, interactions avec les centres de ressources microbiennes). Rédiger des protocoles détaillés d'analyse et former les stagiaires et partenaires. Respecter et faire respecter les règles d'éthique, d'hygiène et sécurité. Participer à la gestion du laboratoire (commandes, suivi des stocks, maintenance) L'IRD est une organisme de recherche public français pluridisciplinaire qui, depuis près de 80 ans, s'engage dans des partenariats équitables avec les pays du Sud et dans les Outre-mer français. Acteur de l'agenda international pour le développement, ses priorités s'inscrivent dans la mise en oeuvre des Objectifs de développement durable (ODD). Ensemble, scientifiques et partenaires de l'Institut proposent des solutions concrètes pour répondre aux défis globaux auxquels les sociétés et la planète font face. Cette relation gagnante-gagnante fait de la science et de l'innovation des leviers majeurs du développement. L'Institut est placé sous la double tutelle du ministère chargé de l'Enseignement supérieur et de la Recherche et de celui chargé des Affaires Étrangères. Être autonome dans la mise en oeuvre des principales techniques de base de biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel ou digitale, séquençage à haut débit). Avoir une expérience d'utilisation des outils de bio-informatique ainsi qu'en langages de programmation utilisés en analyses de données (R, Python) Mener les techniques de microbiologie classique. Rédiger des comptes rendus et des protocoles. Avoir un niveau de connaissance en anglais suffisant pour l'encadrement d'étudiants non francophones Niveau B1-B2. Vous faites preuves des qualités humaines suivantes : Vous êtes consciencieux, rigoureux et patient. Vous avez un goût prononcé pour le travail en équipe. Vous avez des capacités d'adaptation fortes à un nouveau collectif et un environnement multiculturel. De formation approfondie en biologie moléculaire, une expérience en bio-informatique appliquée est essentielle.
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