Ingénieur d'études en bioinformatique - analyse de données de séquençage (h/f)

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UAR3426-HUGPAR-006 Date de début de diffusion 01/06/2026 Date de parution 10/06/2026 Date de fin de diffusion 22/06/2026 Intitulé long de l'offre Ingénieur d'études en Bioinformatique - Analyse de données de séquençage (H/F) Date limite de candidature 22/06/2026 Nature du contrat CDD d'1 an Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en biologie - SVT Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur d'études en Bioinformatique - Analyse de données de séquençage (H/F) Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : La personne recrutée participera aux conseils sur les designs expérimentaux, assurera le contrôle qualité des données NGS et réalisera des analyses bioinformatiques et biostatistiques des données produites sur le plateau en suivant les pipelines existants. Elle sera également amenée à participer aux développements de nouveaux pipelines ou d’outils d’analyse des données. Elle participera à la démarche qualité NFX50-900 (ISO9001). Activités : - Recueillir les données de séquençage haut débit et contrôler leur qualité ; - Réaliser des analyses bioinformatiques et statistiques des données de séquençage haut-débit à l’aide des pipelines existants, en les adaptant si nécessaire, ou par la mise en place de nouveaux pipelines ; - Rédiger des rapports destinés aux clients sur l'analyse qualité, le traitement bioinformatique et l'analyse statistique des données ; - Rédiger des matériels et méthodes et déposer les éléments nécessaires dans des bases de données publiques en vue de leur publication; - Gérer des projets clients, interagir et conseiller ces derniers. - Assurer la veille technologique dans le domaine. - Veiller à la mise en œuvre des procédures d’assurance qualité - Assurer la formation, le support et la maintenance auprès des utilisateurs Contexte de travail : La plateforme MGX sert la communauté biomédicale montpelliéraine en proposant de nombreuses applications basées sur le séquençage haut débit : transcriptomique (RNA-seq, smallRNA-seq), y compris sur cellules uniques (scRNAseq), génotypage (RADseq, GBS), architecture chromatinienne et épigénomique (ChIP-seq, RRBS, WGBS), y compris sur cellules uniques (scATAC-seq) … La qualité des travaux réalisés et de l’organisation de la plateforme est attestée par sa participation à l’infrastructure nationale France Génomique en tant que membre du noyau central, par sa labélisation par le GIS IBiSA, par ses certifications ISO9001 et NFX50-900, et par les enquêtes satisfactions menées chaque année. L’Institut de Génomique Fonctionnelle est une unité mixte INSERM-CNRS-Université de Montpellier composée d’environ 300 personnes qui travaillent en neurosciences, physiologie cardiaque et endocrine et en oncologie. L'ingénieur(e) travaillera en interaction avec les bioinformaticiens et biologistes de la plateforme ainsi qu’avec les chercheurs et ingénieurs des équipes de recherche. Au sein de la partie bioinformatique de l’équipe, la personne recrutée travaillera sous la responsabilité d’un ingénieur de recherche, ainsi qu’avec un ingénieur d’étude. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : Savoir-faire : - Langages : R, Python, bash, LaTeX - Analyse de données de séquençage (notamment RNA-seq et single-cell RNA-seq) - La connaissance d’un gestionnaire de workflow serait un plus (Snakemake, Nextflow) - Connaissances générales dans le domaine de la biologie moléculaire et du séquençage haut-débit (NGS) - Aisance sous Unix, Linux - Anglais scientifique (B2) - Très bonne communication écrite et orale, en français et en anglais - Goût pour le travail en équipe - Esprit d’analyse Savoir-être : - rigueur, sens de l’organisation, autonomie. Contraintes et risques : Pas d’astreinte. 38H30 par semaine. Risques liés au travail sur écran. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) à partir de 2521€ brut mensuel ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes Localisation du poste Europe, France, Occitanie, Hérault (34) Géolocalisation du poste MONTPELLIER Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 34094 MONTPELLIER (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 6 Licence/diplômes équivalents Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français (Seuil)