Ingénieur-e en pathologie végétale

Vos missions en quelques mots -Vous serez accueilli(e) au sein de l’équipe GEMFor (génétique et Ecologie des Maladies Forestières), dans l’unité BioGECO ( Biodiversité, des Gènes aux Communautés). L’équipe GEMFor développe actuellement un programme de recherche sur les maladies fongiques du châtaignier. Dans ce cadre, l’équipe GEMFor coordonne le projet PROSPER (Prophylaxie et solutions pour la santé des châtaigniers). Dans le contexte actuel de l'accélération du changement climatique, la maladie du chancre (causé par Cryphonectria parasitica) et celle de l’encre (causée par Phytophthora cinnamomi) sont une menace pour la préservation des châtaigneraies actuelles et le renouvellement des vergers. Le projet PROSPER (projet PARASA, financé par le ministère de l’Agriculture) a pour objectif de proposer des solutions pour préserver ces ressources et préparer l’avenir, en mobilisant la lutte biologique et prophylaxique. L’équipe GEMFor est en charge d’évaluer l’état sanitaire des pépinières commercialisant des plants de châtaigniers fruitiers et proposer des améliorations des pratiques culturales. Par ailleurs, l’équipe GEMFor est partenaire du projet FORSAID, dans lequel la faisabilité de détection de plants (châtaignier et pin) infectés par un agent pathogène (C. parasitica et nématode du pin) en utilisant la méthode de spectrometrie par proche infra -rouge (SPIR) sera étudiée. Afin de mener à bien ces deux projets, l’UMR BIOGECO recrute un ingénieur d’étude pour une durée de 13 mois à partir d’avril 2026.-Vous serez plus particulièrement en charge de deux tâches des projet PROSPER et FORSAID, sous la responsabilité de Cécile Robin et avec l’appui de l’ingénieure d’étude de l’équipe GemFor. Il s’agit :D’évaluer l’état sanitaire des pépinières fruitières de châtaignier par un travail d’enquêtes et de diagnostic phytosanitaire, D’analyser au SPIR des échantillons prélevés sur châtaigniers et pins.Pour cela il sera nécessaire d’échantillonner en pépinières de châtaignier, d’isoler et identifier des agents pathogènes en réalisant des opérations courantes de biologie moléculaire (extraction ADN, PCR, qPCR…), de participer à l’installation de dispositifs expérimentaux mis en place pour le projet FORSAID et d’utiliser le SPIR en lien avec l’infrastructure Phénobois de Bordeaux.Vous serez également en charge de mettre en forme les données acquises, d’en faire une première analyse de réaliser une veille bibliographique, méthodologique et scientifique, et vous participerez à la rédaction des rapports des projets. Profil recherché -Formation recommandée : Licence, Master -Connaissances souhaitées : microbiologie, biologie moléculaire, phytopathologie, spectrométrie proche infrarouge, analyse de données ; recherche bibliographique ; bonnes pratiques de laboratoire.-Expérience appréciée : microbiologie, biologie moléculaire, analyses statistiques, maitrise R.-Aptitudes recherchées : Curiosité, Motivation, Travail en Equipe, Autonomie, Organisation, Adaptation, Initiative, Dynamisme. Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents