Vos missions en quelques mots Missions : Mettre en œuvre des analyses de données à large échelle sur des séquençages de tumeurs avec instabilité de microsatellite utilisant des pipelines déjà établies au laboratoire. Activités : Le ou la jeune bioinformaticien·ne participera à l’analyse de données de séquençage du génome entier (Whole Genome Sequencing) en utilisant un pipeline d’analyse déjà établi, depuis le contrôle qualité des données brutes jusqu’à l’annotation et l’interprétation des variants. Il ou elle sera chargé·e de l’exécution, du suivi et de l’optimisation courante du pipeline, de la gestion et de la structuration des données, ainsi que de la validation des résultats obtenus. Présentation des données : réunions de laboratoire (en français ou anglais). Contexte de travail : Travail isolé Profil recherché Competences : Maîtrise des scripts Bash pour l’automatisation des analyses, le traitement de fichiers volumineux et la gestion de pipelines bioinformatiques. Expérience de l’utilisation de clusters de calcul haute performance (HPC), incluant la soumission et le suivi de jobs (ex. Slurm, PBS), ainsi que la gestion efficace des ressources de calcul. Compétences en R pour l’analyse de données, la production de graphiques et la visualisation des résultats (statistiques descriptives). Rigueur, sens de l’organisation et aptitude à documenter les analyses (attestée par les modules obtenus au bac et/ou BAC2). Contraintes et risques : Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 5 Diplômes de niveau bac 2 Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français Seuil
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