Description de l'offre
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L’équipe SyMMES/CREAB en collaboration avec deux équipes du CEA LETI et les équipes RDT et LERBO de l’IFREMER sont impliquées dans un nouveau projet ANR ALARMM pour la détection de microalgues dans l’eau de mer (programme PRC 2025, Axe H.11 – Capteurs, imageurs et instrumentation, CE42).
Les efflorescences d’algues toxiques sont des phénomènes sporadiques de plus en plus fréquentes qui représentent un risque sanitaire majeur et ont un impact économique significatif, notamment sur la conchyliculture et le tourisme. Leur détection précoce constitue un véritable défi, rendant indispensable une surveillance efficace du phytoplancton à l’aide de dispositifs performants sur le terrain.
Le projet ALARMM vise à développer un prototype innovant utilisable sur le terrain et reposant sur une méthode de détection et de quantification moléculaire de nouvelle génération : la digital droplet Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) en temps réel. Cette technologie permettra d’identifier et de quantifier avec précision certaines espèces d’algues toxiques faisant l’objet d’un suivi réglementaire.
L’équipe SyMMES/CREAB est plus particulièrement impliquée dans le développement des sondes ou amorces pour l’amplification de l’ADN génomique des microalgues. Le travail du ou de la personne recrutée sera axé sur le développement et l’ingénierie des séquences pour une détection multiplexe (plusieurs microalgues simultanément) et la mise en œuvre des protocoles biologiques (biologie moléculaire, biochimie) pour la détection d’ADN génomique à partir de l’amplification LAMP (une alternative isotherme de la PCR). Des expérimentations seront mises en place afin de démontrer les possibilités de quantification des cibles ADN avec un appareil commercial QuantStudio et les résultats seront comparés à ceux obtenus avec le prototype de terrain développé en parallèle au CEA LETI.
Profil du candidat
👤 Votre profil
Formation initiale : Master2 ou Ingénieur(e) en biochimie / biologie moléculaire / biotechnologies / génie biologique.
🧠 Compétences techniques et comportementales
· Rigueur et méticulosité sont exigées pour mener à bien ces travaux.
· Une expérience en amplification de l’ADN est indispensable.
· Une expérience avec la LAMP et les appareils QuantStudio est un plus.
· Attiré(e) par un environnement pluridisciplinaire et l’innovation technologique.
Très bonne communication pour partager informations et résultats entre différentes équipes
🛠️ Vos missions
· Développement d’amorces (sondes) pour l’amplification de l’ADN génomique de microalgues
· Ingénierie de séquences pour le multiplexage à plusieurs cibles différentes
· Etude expérimentale de l’amplification d’ADN génomique par LAMP (Amplification isotherme similaire à la PCR) : préparation des solutions et des échantillons biologiques, mise au point de l’amplification d’ADN sur un système commercial QuantStudio, interprétation des résultats.
· Participation et présentation des travaux aux réunions d’avancement du projet ANR ALARMM
🤝 Pourquoi nous rejoindre ?
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Conformément aux engagements pris par le CEA en faveur de l'intégration des personnes handicapées, cet emploi est ouvert à toutes et à tous. Le CEA propose des aménagements et/ou des possibilités d'organisation pour l'inclusion des travailleurs handicapés
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