Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète
Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.
L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.
Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.
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Date de clôture de réception de candidatures : 20/04/2026
Vous serez basé dans le Laboratoire Environnement Profond de l'Unité BEEP (Biologie et Ecologie des Ecosystèmes marins Profonds) de l'Ifremer, situé sur le campus du centre Ifremer Bretagne.
Les écosystèmes marins profonds présentent une grande diversité biologique liée à la variabilité des environnements benthiques. La biodiversité et la dynamique naturelles de ces écosystèmes sont encore mal connues. Malgré notre exploration partielle de ce vaste domaine, nous savons que tous les habitats marins, y compris les fosses les plus profondes, subissent des impacts humains directs ou indirects.
Dans ce contexte, l'unité BEEP développe des projets de recherche visant à acquérir des connaissances sur la biodiversité et le fonctionnement de ces écosystèmes afin de soutenir le développement d'une gestion durable de l'environnement et de proposer des solutions pour une utilisation responsable des ressources naturelles des grands fonds marins.
L'utilisation de l'imagerie in situ comme méthode d'étude des écosystèmes profonds (faune et habitat) s'est généralisée au Laboratoire Environnement Profond (LEP), à la fois pour l'étude de la dynamique temporelle des communautés benthiques et pour la cartographie des habitats et distribution de la faune, avec une acquisition régulière dans l'espace, le long de transects d'engins sous-marins ou caméras tractées, ou par le biais d'observatoires fond de mer pour des suivis temporels (observatoires fonds de mers EMSO-Açores, MARLEY et ScInObs-Nouvelle Calédonie, campagnes annuelles).
L'analyse de ce type de données représente une activité importante du LEP qui a développé depuis plusieurs années des outils d'analyse automatique d'images afin de répondre au besoin grandissant de traitement de l'imagerie acquise en masse par ces systèmes. Ces développements ont été réalisés dans le cadre de divers projets (PAMELA, iAtlantic, MARHA, ScInObs, EMSO) au travers de collaborations avec des écoles d'ingénieurs (e.g. ISEN, ENIB, IMT-A) ou par le recrutement d'ingénieurs en informatique spécialisés en traitement d'images et/ou en intelligence artificielle (IA).
Dans ce contexte, vous travaillerez au sein d'une équipe composée de chercheurs en écologie benthique, d'ingénieurs en microscopie et en imagerie, et de techniciens en biologie. Par ailleurs vous serez en régulière interaction avec le département IRSI (Infrastructures de Recherche et Systèmes d'Information) qui assure la gestion et le développement des systèmes de gestion de données marines de l'Institut ou de projets partenariaux, supportant l'ensemble des fonctionnalités d'acquisition, de contrôle, de bancarisation, de pérennisation et d'accès à l'information.
Vous serez placé, au sein du LEP, sous la responsabilité de l'ingénieure biologiste imagerie et co-encadré par une ingénieure en IA du Département IRSI. Vous profiterez également d'interactions avec les équipes responsables des développements techniques associés (logiciels spécifiques, capteurs, gestion de données).
Quelles seront vos missions ?
Vous participerez à l'application et au développement d'algorithmes de détection automatique d'espèces et de substrats sur des séries temporelles ou spatiales d'images marines, ainsi qu'à la mise à jour et à la pérennisation des scripts et logiciels de traitement d'images développés par le laboratoire.
Vous contribuerez ainsi au renforcement des compétences en informatique et IA du LEP et à la valorisation et à la pérennisation des outils d'analyse d'image permettant leur utilisation en routine, jusqu'ici limitée.
Vous travaillerez sur tous les cas associés aux chantiers clés du département (Golfe de Gascogne, dorsale médio-Atlantique, Pacifique Ouest) et contribuerez in fine à la caractérisation de la structuration spatio-temporelle des communautés et habitats benthiques.
Quelles seront vos activités ?
- Application d'outils de traitement d'images sur les jeux de données en attente d'analyse
- Réalisation des évolutions et mises à jour nécessaires à la pérennité des outils de traitement d'images
- Participation à l'intégration de ces outils dans des plateformes partagées et interactives (de type VRE) qui permettent de faciliter l'accès aux données et aux ressources des infrastructures (calcul, logiciels, documentation,)
- Participation à la rédaction de documentation
Avec qui allez-vous travailler ?
- En interne : Unité BEEP ; Département IRSI (Infrastructures de Recherche et Systèmes d'Information)
- En externe : Ecoles d'ingénieurs, partenaires aux niveaux national (e.g. Pôle ODATIS) et international (e.g. projets européens)
Comment se déroulera votre activité ?
- Travail de programmation sur ordinateur
- Points réguliers avec l'équipe encadrante pour le suivi et la planification des activités
- Rédaction de documents techniques
- Participation à la vie du laboratoire et du service encadrants (réunion de laboratoire/service, présentations scientifiques, ), et de l'Institut
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